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Kyrtuthrix与Nunduva的分子系统学解析:形态差异显著但分子特征隐密的蓝藻属级分类研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月04日 来源:Journal of Phycology 3.4
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这篇研究通过多基因测序(16S rRNA、rpoC1、rbcLX等)和形态学分析,揭示了蓝藻目(Cyanobacteriota)中Kyrtuthrix与Nunduva属的分子系统关系。尽管二者形态差异显著(如U型丝状体排列与假分枝结构),但16S rRNA基因相似性高达97%以上,仅通过多基因联合分析(BI/ML)才明确其为姐妹群。研究强调了结合分子与形态数据对经典属(如模式种K. dalmatica)定界的重要性,为海洋蓝藻分类提供了关键参考。
研究聚焦于蓝藻目Rivulariaceae科的Kyrtuthrix属模式种K. dalmatica(1929年由Ercegovi?描述)及其近缘种K. maculans的分子特征。传统分类因丝状体等极性将其归入Scytonemataceae科,但分子证据支持其属于Rivulariaceae科。近年发现的4个新种(如墨西哥海岸的K. huatulcensis)表明该属并非均为石内生的(euendolithic)。研究通过16S rRNA、ITS rRNA、rpoC1和rbcLX基因测序,结合形态学分析,揭示了Kyrtuthrix与形态迥异但分子隐密的Nunduva属的演化关系。
近20年蓝藻基因序列暴增,但许多因BLAST错误匹配导致分类混乱。本研究通过测序模式种(如Oscillatoria princeps、Nostoc commune)解决此类问题。Kyrtuthrix属包含2个经典种(克罗地亚的K. dalmatica和泰国的K. maculans)及3个墨西哥新种。其全球分布从温带到热带海域,生态位包括潮间带和潮上带。
采样与培养:从克罗地亚?iovo岛(模式产地)、秘鲁Paracas和法国Goury采集样本,经人工海水培养基(ASM)纯化培养。分子分析:使用NucleoSpin Plant II试剂盒提取DNA,扩增16S rRNA、ITS rRNA、rpoC1和rbcLX基因,克隆后Sanger测序。系统发育分析采用贝叶斯推断(BI)和最大似然法(ML),模型为GTR+I+G,通过CIPRES平台完成。
形态特征:K. dalmatica Cr5形成300–350 μm的U型平行丝状体,细胞宽6.0–8.4 μm,末端渐尖(1.0–2.0 μm)。K. maculans PE16丝状体长130–200 μm,产生22–58 μm的藻殖段(hormogonia)。法国株N3形态介于二者之间。分子特征:16S rRNA基因分析显示Kyrtuthrix与Nunduva相似性≥97%,但多基因联合分析(图S1)支持二者为姐妹群。ITS rRNA区二级结构显示D1-D1′螺旋分两种类型(64 nt与60–62 nt),Box-B和V3螺旋结构变异显著。
Kyrtuthrix与Nunduva的形态差异(如U型排列vs.假分枝)与分子隐密性形成鲜明对比。类似案例见于Raphidiopsis/Cylindrospermopsis(因固氮基因丢失导致异形胞缺失)。研究主张暂保留两属,需更多基因组数据验证。次级结构分析提示可能存在平行进化,但D1指数(DIV)未达旁系同源阈值。
指定K. dalmatica的 lectotype 为Ercegovi? (1929) 的图3,并新增 epitype(标本CBFS A258-1)。
研究凸显了整合多基因数据与形态生态特征在蓝藻分类中的必要性,为海洋微生物多样性研究提供了范式。
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