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基因倒位(Inversions)主导欧洲沙丁鱼(Sardina pilchardus)在强基因流背景下的适应性进化
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月04日 来源:Molecular Ecology 3.9
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研究人员通过全基因组测序(WGS)和群体建模技术,揭示了大型染色体倒位(29-52 Mbp)在维持欧洲沙丁鱼大西洋-地中海群体适应性分化中的核心作用。研究发现这些覆盖半数基因组的倒位与温度等环境因子驱动的生命史策略适应相关,为r-选择物种的进化机制和渔业资源管理提供了新见解。
染色体倒位(Inversions)在物种适应性进化中扮演关键角色,但其跨物种影响机制仍不明确。这项针对r-选择物种欧洲沙丁鱼(Sardina pilchardus)的研究,通过对34个种群数百万SNPs的群体基因组分析,发现数个长度达29-52兆碱基(Mbp)的大型倒位区域,这些区域覆盖了超过50%的基因组并呈现极端选择信号。
研究发现这些倒位与大西洋和地中海群体间关键生命史性状的适应性分化密切相关。在大西洋群体中,倒位等位基因频率呈现纬度梯度变化;而地中海群体则表现为经度梯度变异,这种分布模式与影响沙丁鱼生命史策略的温度和海洋学特征高度吻合。值得注意的是,在环境差异显著的相邻种群间,倒位频率存在显著差异并伴随基因流阻遏现象。
相比之下,中性位点分析显示该物种存在广泛的基因流(gene flow),呈现典型的距离隔离模式(isolation by distance),仅在大西洋-地中海盆地间(除加那利群岛外)存在群体结构分化。这些证据表明,在强基因流背景下,大型染色体倒位通过维持局部适应性变异,塑造了欧洲沙丁鱼基因组多样性格局。该研究为理解海洋生物适应性进化机制提供了新视角,对气候变化背景下这一重要经济鱼种的种群界定与管理具有重要指导价值。
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