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人源TANGO2蛋白αββα折叠晶体结构揭示其Ntn水解酶家族特性与TANGO2缺乏症(TDD)的分子机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月04日 来源:Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 2.8
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这篇研究首次解析了人源运输和高尔基体组织蛋白2同源物(TANGO2)1.70 ?高分辨率晶体结构,证实其具有N端亲核氨基水解酶(Ntn)超家族典型的αββα折叠特征。研究通过结构分析揭示了保守的催化位点(Cys2)和配体结合腔,提出TANGO2可能通过水解酰基辅酶A(acyl-CoA)参与脂质代谢的分子机制,为理解TANGO2缺乏症(TDD)患者线粒体功能障碍、心肌病等多系统异常的病理机制提供了结构基础。
TANGO2蛋白的αββα折叠结构特征
重组人源TANGO2蛋白的晶体结构显示其核心由两组β折叠(BG1/BG2)和外围α螺旋(AG1/AG2)构成典型的αββα折叠,与Ntn水解酶家族结构高度相似。质量谱分析证实N端甲硫氨酸(M1)缺失,且Cys2存在氧化修饰,暗示其可能作为催化亲核试剂参与自激活过程。结构比对发现,TANGO2与细菌肽酶C45(3GVZ)、胆汁盐水解酶(7SVG)等Ntn水解酶的活性中心半胱氨酸空间位置高度保守。
配体结合腔与潜在水解功能
通过CAVER分析发现,TANGO2的β折叠核心存在容积达1580 ?3的主腔室和254 ?3的次级腔室。X射线衍射数据捕获到磷酸根离子(P1)与R32/K56/R88形成的正电结合口袋,而磷酸盐非依赖结晶条件仍保留该位点配体,提示其可能参与辅因子结合。分子对接显示,棕榈酰辅酶A(palmitoyl-CoA)的腺苷二磷酸基团与磷酸结合位点重叠,而棕榈酰乙醇酰胺(PEA)的脂肪链可嵌入疏水腔,其羰基碳与Cys2距离3 ?,符合Ntn水解酶切割酰胺键的催化几何要求。
TDD致病突变的结构扰动
针对TDD患者常见错义突变(G154R、L50P等)的结构分析表明:
G154R突变位于β11折叠,精氨酸侧链引入可能导致α3螺旋位移;
L50P通过脯氨酸刚性破坏β3/β5折叠氢键网络,AlphaFold预测该突变引起局部解旋;
位于α3螺旋的K166E突变则因谷氨酸负电荷干扰Y224氢键,导致α6螺旋紊乱。这些突变均位于活性中心10 ?范围内,可能通过破坏蛋白折叠或底物识别导致功能丧失。
oligomerization状态与功能启示
尺寸排阻色谱显示TANGO2在溶液中以单体(95%)为主,但晶体中形成埋藏面积677.8 ?2的弱相互作用二聚体。近期质谱光散射研究提出其三聚体/六聚体可能存在,暗示其寡聚化可能受浓度或翻译后修饰调控。不同于经典Ntn水解酶的多聚体特征,TANGO2的单体优势可能反映其对酰基辅酶A等脂质前体的动态处理机制。
治疗策略的结构线索
研究指出维生素B5(泛酸)可改善TDD患者ER-高尔基体运输缺陷,其作为辅酶A前体可能补偿TANGO2功能缺失导致的脂肪酸代谢障碍。结构模型显示,NRDE基序(25-28位)构成酰基辅酶A结合关键区域,为设计小分子稳定剂提供靶点。此外,突变引发的局部构象变化提示基因治疗需考虑空间位阻补偿。
这项研究首次将TANGO2的结构与功能关联,为解析TDD的复杂临床表现(心律失常、横纹肌溶解等)提供了分子框架,同时为开发靶向Ntn水解酶活性的治疗策略奠定基础。
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