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植物自噬过程中ATG8亚型结构灵活性与形状相似性对其特异性功能的调控机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月04日 来源:Molecular Informatics 3.1
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来自国际团队的研究人员针对植物自噬过程中ATG8亚型与受体/适配体选择性相互作用的分子机制展开研究。通过生物信息学分析和分子动力学(MD)模拟,揭示了ATG8亚型在自噬体生物发生中的阶段依赖性功能,发现尽管具有高度保守的蛋白互作界面(W/L位点),不同亚型对特定配体仍表现出显著结合偏好。该研究为阐明植物自噬调控网络提供了新视角。
最新研究发现,植物自噬相关蛋白(ATG8)的不同亚型在自噬过程中展现出令人惊异的"精准分工"现象。尽管这些亚型拥有高度相似的蛋白互作口袋(W-site和L-site),它们却能像智能钥匙般精准识别特定的受体和适配体。科研团队通过构建人、酵母和植物ATG8的进化树,将植物ATG8分为三个功能组,并运用分子动力学(MD)模拟技术破解了这一选择性奥秘。
研究聚焦于LC3相互作用区(LIR)的双重功能——既参与自噬体形成,又介导选择性自噬受体(SAR)的招募。通过根均方偏差(RMSD)聚类分析,团队捕捉到ATG8与不同配体结合时的动态构象变化。特别有趣的是,虽然所有ATG8亚型都保持保守的二级结构,但代表三个功能组的典型成员在与肽段结合时展现出明显的"择偶偏好"。
这项研究不仅揭示了植物自噬调控的精细分子机制,更为重要的是,它提出了一个创新性研究框架——将序列分析、结构生物学和动态模拟相结合,为破解其他生物体系中类似的选择性互作难题提供了方法论借鉴。拟南芥( A. thaliana )作为模式生物再次证明其在基础研究中的独特价值,相关发现可能为作物抗逆性改良提供新的分子靶点。
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