综述：微生物组研究进展：对传染病管理和治疗的意义

这篇综述系统探讨了人类微生物组（Microbiome）在健康和疾病中的核心作用，重点解析了微生物失衡（Dysbiosis）与感染易感性、疾病严重程度的关联。文章整合了高通量测序（NGS）、生物信息学和机器学习（ML）技术，评估了益生菌（Probiotics）、工程菌等治疗策略的临床转化挑战，为传染病精准诊疗提供了新视角。

　　

微生物组：健康与疾病的守门人

Abstract

人类微生物组如同一个复杂的生态系统，其平衡状态直接关系到宿主对病原体的防御能力。当微生物群落失衡（Dysbiosis）时，可能导致定植抗性（Colonization Resistance）减弱、免疫调节（Immune Modulation）异常，进而增加感染风险。COVID-19等疫情更凸显了微生物组作为预测感染结局的生物标志物潜力。

Methods

通过高通量测序（NGS）和机器学习（ML）技术，研究者能够解码微生物组的动态变化。生物信息学工具如MetaPhlAn²和QIIME²助力识别关键菌属，而随机森林算法可筛选与感染相关的预测性特征。治疗策略方面，工程化益生菌（如Syn-SCFA菌株）和短链脂肪酸（SCFAs）等代谢产物的应用成为研究热点。

Results

临床数据显示，肠道菌群中Faecalibacterium prausnitzii的丰度与呼吸道感染风险呈负相关，而拟杆菌门/厚壁菌门比值升高可能预示抗生素耐药性。在治疗领域，粪菌移植（FMT）对艰难梭菌感染（CDI）的治愈率达90%，但个体差异和监管框架限制了其推广。

Conclusion

未来需通过多组学整合（如宏基因组+代谢组）解析微生物组-宿主-病原体三方互作。标准化样本采集流程和FDA/EMA监管指南的完善，将是推动微生物组疗法（Microbiome-based Therapies）进入临床的关键。值得注意的是，噬菌体疗法（Phage Therapy）或成对抗超级细菌的新突破口。