匈牙利高毒力肺炎克雷伯菌血流感染的首次流行病学调查及基因组特征解析

【字体: 时间:2025年08月05日 来源:Microbiology Spectrum 3.8

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  (编辑推荐)本研究首次系统报道了匈牙利地区高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)在血流感染中的流行现状,通过全基因组测序揭示ST86/ST5/ST6771克隆株携带rmpA/iucABCD等毒力基因的分子特征,证实毒力质粒PTU-E21和染色体ICEKp1元件的跨洲传播潜力,为欧洲hvKP防控提供关键数据。

  

ABSTRACT
高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)可导致健康人群严重感染。匈牙利佩奇大学医院首次针对2020-2022年157例肺炎克雷伯菌血流感染分离株进行研究,发现3株(2%)携带rmpA和iutAiucABCD毒力基因。全基因组测序显示这些菌株分属ST5、ST86和ST6771(ST893单一位点变体)国际流行克隆株,其中ST86和ST6771菌株的毒力基因位于与亚洲分离株高度相似的质粒上,而ST5菌株的毒力基因定位于染色体ICEKp1元件。核心基因组MLST分析表明,匈牙利ST86分离株KP48326与希腊菌株ID-48733存在基因组高度相似性(43个SNP差异)。

INTRODUCTION
肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)是革兰阴性条件致病菌,传统菌株(cKP)主要感染免疫缺陷人群,而hvKP则可通过rmpA/A2、aerobactin等毒力因子引发健康人群的肝脓肿、坏死性筋膜炎等侵袭性感染。研究显示亚洲地区hvKP血流感染占比高达73.9%,而欧美普遍低于10%。匈牙利此前缺乏系统性研究数据。

RESULTS
临床特征
14株菌呈现高粘液表型,但仅3株(KP48326/KP873/KP7389)PCR确认携带rmpA/A2和iucA基因。病例分析显示:

  • KP48326(ST86):45岁女性社区获得性肺炎,合并高血压和糖尿病
  • KP873(ST5):80岁女性社区获得性肺炎,后续死于新冠感染
  • KP7389(ST6771):72岁女性医院获得性血流感染,冠脉搭桥术后

基因组特征

  • 毒力基因定位:ST86/ST6771菌株毒力基因位于PTU-E21型质粒(>99.9%序列相似性),ST5菌株通过ICEKp1染色体元件携带rmpA/yersiniabactin/salmochelin基因簇
  • 国际传播证据:ST86匈牙利分离株与希腊菌株核心基因组差异仅13个等位基因
  • 抗生素敏感性:所有菌株仅对氨苄西林天然耐药,未检出获得性耐药基因

DISCUSSION
本研究首次确认匈牙利存在ST86/ST5/CC893等国际hvKP克隆株,2%的流行率与意大利(1.3%)、克罗地亚(3.3%)相当。值得注意的是:

  1. PTU-E21毒力质粒缺乏接合转移系统,暗示存在未知传播机制
  2. ST5克隆株ICEKp1元件介导的染色体整合毒力基因可能增强致病性
  3. 高龄合并症患者临床表现较轻,与亚洲报道差异显著

MATERIALS AND METHODS
采用MALDI-TOF MS鉴定菌株,通过string test表型筛选和PCR毒力基因检测。结合Illumina/Nanopore双平台测序完成基因组组装,使用COPLA分析质粒分类单元,Proksee进行基因组可视化。

该研究为中东欧地区hvKP分子流行病学研究奠定基础,强调需建立基于全基因组监测的防控体系以应对毒力-耐药基因共传播的公共卫生威胁。

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