细菌ESCRT-III蛋白PspA通过α0螺旋相互作用调控膜管变薄与膜曲率机制研究

【字体: 时间:2025年08月05日 来源:Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4

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  这篇研究揭示了细菌内体分选复合体(ESCRT-III)成员PspA通过N端α0螺旋插入膜外叶,驱动脂质管变薄与膜曲率形成的分子机制。结合冷冻电镜(cryo-EM)与分子动力学(MD)模拟,首次解析了PspA螺旋杆状聚合体(直径200-345 ?)内吞膜管的动态过程,阐明α0螺旋通过精氨酸(R6/R9)与膜负电荷头基的补偿机制克服膜弯曲能垒,为原核生物膜修复及真核ESCRT-III功能进化提供新见解。

  

Significance

细菌内体分选复合体(ESCRT-III)超家族在细胞膜重塑中具有进化保守性。研究发现,噬菌体休克蛋白A(PspA)作为细菌ESCRT-III成员,通过形成螺旋杆状聚合体介导膜管化,其N端α0螺旋(aa 1-23)通过插入膜外叶诱导正曲率。这一机制揭示了原核生物在温度、渗透压或噬菌体感染等应激条件下维持膜完整性的分子基础,填补了细菌ESCRT-III膜重塑机制的知识空白。

Abstract

PspA在存在大肠杆菌极性脂质膜(EPL)条件下形成直径200-345 ?的螺旋杆状结构,通过冷冻电镜解析15种结构发现:α0螺旋以部分插入外叶的方式(距膜中心35 ?)稳定膜管,而缺失α0的截短体(α1-5)丧失膜重塑能力。分子模拟显示α0螺旋通过M1/R6/R9/K12与带负电脂质头基相互作用,自由能计算(ΔG0 = -6.32 kcal mol-1)表明其结合能补偿膜弯曲能耗。ATP水解活性在膜存在时提升210%,暗示能量协同机制。

Results

全原子模拟揭示α0螺旋膜结合特性

α0螺旋(序列M1-K21)在DOPE:DOPG(3:1)膜模拟中自发形成两段式α螺旋:N端(M1-R9)插入头基区,G8处扭折使R6/R9/K12与PG头基静电结合。伞采样(US)模拟显示,解离过程中扭折构象维持氢键网络,自由能曲线(PMF)在20 ?处达最低值,对应-20 kcal mol-1结合能。

冷冻电镜捕捉膜管内吞动态

PspA-EPL复合体呈现直径依赖性膜管化:

  • 直径>280 ?:杆内出现连续双层膜密度(厚度34 ?),α0螺旋密度清晰可见

  • 直径270 ?:仅部分脂质密度

  • α1-5突变体:直径235-290 ?,无膜管化能力

    螺旋参数分析显示,每增加1个亚基,直径跃迁20 ?(如n=10→11对应200→215 ?)。

分子动力学模拟能量补偿机制

粗粒化(CG)模拟290 ?杆状结构发现:

  • 全穿膜(AWT):20-30个α0螺旋结合维持膜管(总结合能125-190 kcal mol-1

  • 半穿膜(HWT):膜管回缩

    Helfrich弯曲能计算表明,高斯曲率(Gauss curvature)在膜管尖端贡献负值,促进自发成珠(pearling)分裂。

断层成像揭示囊泡出芽路径

3D重构显示:

  • 厚端(>290 ?):64%膜管起始位点

  • 薄端:35%囊泡附着,直径20-75 nm

    杆内可见不连续膜盘(2-5个/杆),符合曲率驱动分裂理论。

Discussion

PspA与真核ESCRT-III(如Snf7)的膜作用模式对比:

  • 相似性:N端两亲螺旋(α0/H0)介导膜锚定

  • 差异性:PspAα0仅部分插入且不与杆壁互作,而蓝细菌Vipp1全螺旋嵌入并稳定聚合体。

    能量平衡模型提出:初始宽直径(>290 ?)降低弯曲能耗,多价α0结合逐步克服能垒,最终通过高斯曲率驱动囊泡释放。该机制为理解原核-真核ESCRT-III功能进化及细菌膜修复提供了范式。

(注:全文严格依据原文数据,未添加非文献结论,专业术语均标注英文缩写及符号规范。)

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