基因组学证据挑战雌性回归假说：白鲨线粒体-核基因组不一致现象研究

为解决鲨鱼中线粒体-核基因组不一致(mitonuclear discordance)现象的成因问题，研究人员通过构建染色体级别基因组图谱，结合常染色体和单亲遗传标记数据，对白鲨种群历史进行重建。研究发现即使极端雌性回归(female philopatry)条件下，模拟结果仍无法解释线粒体变异模式，提示需要重新审视鲨鱼雌性回归现象的普遍性假设。

　　

这项关于白鲨性别偏向性扩散的研究揭示了令人惊讶的发现。通过构建染色体级别的高精度基因组(genome assembly)和全基因组重测序数据，研究团队重建了该物种的历史种群动态(demographic history)。常染色体数据显示，白鲨曾作为单一随机交配(panmictic)种群存在，近期才分化为三个主要遗传群体。

然而线粒体数据(mtDNA)却展现出截然不同的模式，与常染色体多样性分布存在显著不一致(mitonuclear discordance)。研究人员采用基于常染色体数据建立的种群历史模型，通过溯祖模拟(coalescent simulation)和正向模拟(forward simulation)方法，特别构建了性别偏向繁殖模型(sex-biased reproduction model)来追踪常染色体、Y染色体和线粒体DNA的遗传模式。

模拟结果显示，虽然Y染色体变异模式与观测数据吻合，但线粒体变异模式即使在完全限制雌性迁移(extreme female philopatry)的极端条件下也无法重现。这一突破性发现强烈暗示，单凭种群统计学(demography)因素无法完全解释鲨类中普遍存在的线粒体-核基因组不一致现象。该研究建立的模拟框架为重新评估其他鲨鱼物种的雌性回归假说提供了重要工具。