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厌氧氨氧化菌Kuenenia stuttgartiensis中一氧化氮形成亚硝酸盐还原酶的多样性及其生理意义
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月05日 来源:FEBS Open Bio 2.3
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这篇研究揭示了厌氧氨氧化菌(anammox)Kuenenia stuttgartiensis通过两种可溶性亚硝酸盐还原酶(NirS和HAOr)维持一氧化氮(NO)池的分子机制。研究结合快速蛋白液相色谱(FPLC)富集技术和膜进样质谱(MIMS)活性分析,证实NirS和HAOr在体外均能高效催化亚硝酸盐还原为NO,其冗余性可能增强菌株对环境亚硝酸盐浓度波动的适应性,为理解anammox细菌的氮循环策略提供了新视角。
研究首先通过细胞分级实验发现,99%的亚硝酸盐还原活性存在于可溶性蛋白组分中,膜蛋白仅贡献7%且活性在4分钟后停止。使用膜进样质谱(MIMS)监测15N-亚硝酸盐转化为15NO的过程,测得可溶性蛋白的比活性达12 nmol·min-1·mg-1,较粗提物富集2倍。这一结果明确否定了膜结合蛋白Kuste4574作为主要催化酶的假说。
采用低分辨率阴离子交换层析(Q-Sepharose)分离可溶性蛋白,发现65%的活性集中于峰B(9-17组分),其中亚组分B1(11-14组分)比活性达18 nmol·min-1·mg-1。非结合组分(FT)虽仅占5.3%总活性,但比活性高达14 nmol·min-1·mg-1,提示存在另一种高效还原酶。
对活性峰B1进行高分辨率Source 15Q柱分离后,第9组分比活性飙升至336 nmol·min-1·mg-1(富集29倍)。蛋白质组学显示细胞色素cd1型亚硝酸盐还原酶NirS(kuste4136)的相对丰度与活性高度正相关(Pearson r=0.87),其表达量虽低于其他anammox核心酶,但高比活性可能弥补了低丰度缺陷。
通过羟基磷灰石混合模式层析分离FT组分,发现UV峰4的比活性达62.5 nmol·min-1·mg-1,较既往纯化HAOr的报道活性高125倍。蛋白质组学证实HAOr(kustc0458)丰度与活性显著相关(r=0.99),其与电子传递伙伴kustc0457可能形成高效还原系统。
NirS和HAOr的共存可能赋予K. stuttgartiensis应对环境波动的双重优势:NirS的高催化速率(接近反硝化菌的1/12)适合高亚硝酸盐条件,而HAOr的广泛保守性可能保障基础NO供应。值得注意的是,两种酶在亚硝酸盐限制条件下均显著上调(NirS上调10倍,HAOr 2.5倍),但具体调控机制仍待解析。免疫金定位显示HAOr靠近anammoxosome膜,而NirS的亚细胞定位尚未明确,这为后续研究酶的空间组织与电子传递链偶联提供了方向。
研究同时讨论了近期争议:尽管有团队提出羟基胺脱氢酶(HOX)可能参与还原,但本数据表明其在活性峰中的相关性(r=0.60)显著低于NirS(r=0.87)。这种功能冗余现象与某些反硝化菌同时携带NirS/NirK的案例类似,但anammox菌中双还原酶的进化驱动力仍需从能量守恒(如anammoxosome膜电位耦合)角度深入探索。
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