大型基因组植物性别特异性分子标记的简化基因组测序(ddRAD)鉴定新策略

【字体: 时间:2025年08月05日 来源:Plant Biosystems - An International Journal Dealing with all Aspects of Plant Biology 1.6

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  来自某研究团队的研究人员针对大型基因组非模式植物性别鉴定难题,开发了基于简化基因组测序技术(ddRAD)的生物信息学流程。该研究以苏铁属植物Cycas revoluta为模型,通过与近缘种C. panzhihuaensis全基因组测序(WGS)数据的交叉验证,成功鉴定了性别相关基因组区域,为大型基因组植物的性别标记开发提供了高效解决方案。

  

最新测序技术的突破性进展,显著提升了科学界对雌雄异株(dioecious)物种性别决定基因组区域的解析能力。在这项创新研究中,研究者另辟蹊径地采用简化基因组分析技术(ddRAD),替代传统全基因组测序(WGS)方案,成功应用于具有超大基因组的非模式植物——苏铁(Cycas revoluta)。研究团队特别开发了专属生物信息学流程,通过与近缘种攀枝花苏铁(Cycas panzhihuaensis)已发表的WGS数据进行跨物种比较验证,不仅确认了性别相关基因组区域的存在,更开创性地证实了ddRAD-seq技术在大型基因组植物性别标记开发中的卓越效能。这项突破性工作为植物性别决定机制研究提供了高效、经济的"快车道"方案。

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