中国沿海银鲳(Pampus argenteus)纬度环境梯度驱动的局域适应性遗传机制解析

为解析中国沿海银鲳(P. argenteus)种群在纬度环境梯度下的适应性分化机制，研究人员对6个地理种群的117个基因组进行重测序。研究发现尽管缺乏全基因组层次结构，但50%以上单核苷酸多态性(SNPs)显示中度至强分化，鉴定出21个受距离与环境隔离影响的100-kb选择窗口。关键基因涉及昼夜节律调控、热应激响应及神经元活动调控，提示海表温度与日照时长为选择压力，非编码区1204个SNPs与14个转录翻译因子共同构成基因表达调控的适应性基础。

　　

沿着中国海岸线从亚热带到亚寒带的显著纬度环境梯度中，银鲳(Pampus argenteus)展现出令人惊奇的生态可塑性。这种具有经济价值的鱼类在沿海形成多个地理种群，各自展现独特的产卵习性和栖息地偏好，暗示着潜在的遗传分化现象。

通过高通量基因组重测序技术，科研团队对中国六个沿海种群的117个银鲳个体进行全基因组扫描。虽然群体遗传分析未发现明显的等级结构，但超过半数单核苷酸多态性(SNPs)在至少两个种群中呈现中度到强烈的分化特征。曼特尔检验揭示出21个100-kb的基因组滑动窗口存在显著的环境-距离隔离效应，这些"热点区域"可能正承受着纬度环境梯度的选择压力。

深入分析发现，这些选择窗口富含与生物钟(circadian clock)调控和温度应激响应相关的基因，暗示海表温度(SST)和日照时长是驱动适应的关键环境因子。更有趣的是，17个参与神经元活动的基因周围存在显著变异，这些遗传改变可能塑造了不同种群特有的产卵迁徙行为策略。

研究还捕捉到1204个位于非编码区的SNPs变异，并在选择窗口内鉴定出14个转录因子(TFs)和翻译调控元件。这些发现勾勒出一幅完整的适应图景：银鲳种群通过蛋白质编码序列的定向选择与非编码调控元件的协同进化，最终实现了对中国复杂海岸线环境的完美适应。这种"遗传工具箱"的巧妙组合，为理解海洋生物纬度适应性提供了新的分子视角。