基于GBS-GWAS分析的番茄种质黑果性状基因标记开发及其育种应用

为解决黑番茄(Solanum lycopersicum)育种中精准鉴定的难题，研究人员通过GBS-GWAS技术对192份番茄材料进行分析，定位到7号和10号染色体上10个显著SNP位点，开发出基于MYB转录因子(Solyc07g052490/Solyc10g086260)的3个100%准确分子标记，为黑番茄高效育种提供重要工具。

　　

这项突破性研究揭示了黑番茄(Solanum lycopersicum)独特花青素积累的遗传密码。通过基因分型测序(GBS)和全基因组关联分析(GWAS)，科研团队在192份番茄种质中精准锁定7号和10号染色体上的10个关键单核苷酸多态性(SNP)，这些位点对黑果性状的判别准确率高达98.82-98.96%。

深入挖掘发现，MYB样转录因子ETC1(Solyc07g052490)和R2R3-MYB转录因子双胞胎基因(Solyc10g086250/Solyc10g086260)是调控黑色表型的"分子开关"。其中，Solyc07g052490基因上的2个SNP和Solyc10g086260基因上的5个SNP构成"遗传指纹"，据此开发的B07_2490-2、B10_6260-1和B10_6260-3三个标记犹如基因雷达，实现黑番茄100%精准识别。

这项成果不仅破解了番茄"黑美人"的着色密码，更搭建起从实验室到田间的分子育种快车道。育种家们现在可以像使用条形码扫描器般，在幼苗期就能预判果实颜色，将传统育种周期压缩60%以上，为功能型番茄品种选育按下加速键。