新型三氟二羟基丙酮药效团选择性抑制人碳酸酐酶IX的抗癌药物设计与机制研究

【字体: 时间:2025年08月06日 来源:European Journal of Medicinal Chemistry 5.9

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  这篇研究报道了一类以三氟二羟基丙酮(TDP)为锌结合功能基团的新型选择性人碳酸酐酶IX(hCA IX)抑制剂。通过合成优化、X射线晶体学分析和计算模拟,证实该系列化合物对hCA IX具有亚微摩尔级选择性抑制活性(KI值达纳摩尔范围),并在胰腺癌细胞系(常氧/缺氧条件下)展现显著抗增殖作用。研究揭示了TDP类化合物通过干扰线粒体功能或铁代谢的潜在抗癌机制,为开发靶向hCA IX的抗癌药物提供了新思路。

  

亮点

• 开发出基于三氟二羟基丙酮(TDP)药效团的新型选择性hCA IX抑制剂

• 代表性化合物对hCA IX的KI值达纳摩尔级抑制水平

• X射线晶体学首次解析TDP与hCA II的结合模式

• 在胰腺癌细胞中显示缺氧条件增强的抗增殖活性

• 揭示通过干扰线粒体功能和铁代谢的潜在作用机制

设计与合成

与磺胺类碳酸酐酶抑制剂(CAIs)类似,先导化合物TDP1的化学结构包含三大特征要素:(a)锌结合基团(ZBG)头部——TDP模块;(b)芳香族骨架;(c)对位甲基尾部(图2A)。通过"尾部优化策略",研究人员系统改造芳香环取代基,获得TDP1-6系列衍生物,显著提升了对hCA IX/XII的选择性抑制能力。

结论

本研究表明TDP这一创新药效团能有效抑制人碳酸酐酶(hCAs),尤其对hCA IX展现出优于胞质亚型的选择性。最具潜力的TDP化合物不仅在分子水平表现优异,还能显著降低缺氧胰腺癌细胞的存活率。全息成像和荧光实验揭示了该类化合物对细胞超微结构的影响,为后续开发靶向hCA IX的抗癌药物奠定了坚实基础。

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