
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
大麦铝耐受性关键转运蛋白HvAACT1的结构解析:揭示柠檬酸外排与DinF亚家族进化关联的分子机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月06日 来源:Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4
编辑推荐:
【编辑推荐】本研究首次解析了大麦铝耐受基因HvAACT1(Multidrug and Toxic Compound Extrusion, MATE家族成员)的晶体结构,揭示其通过N-叶(N-lobe)质子结合位点与C-叶(C-lobe)柠檬酸结合位点的空间分离但功能偶联机制,为植物酸性土壤适应性及阴离子底物转运的进化关联提供结构基础。
结构解析与功能特征
大麦铝耐受性关键基因HvAACT1编码的柠檬酸转运蛋白属于多药和毒性化合物外排(MATE)家族,其通过根系分泌柠檬酸螯合毒性铝离子(Al3+)。研究团队通过晶体学手段解析了HvAACT1的外向构象(分辨率3.2 ?),发现其具有典型的V形拓扑结构,包含N-叶(TM1-TM6)和C-叶(TM7-TM12)两个叶瓣。C-叶腔室富含正电荷,由K126TM2、R358TM7和R535TM12构成柠檬酸结合位点;而N-叶腔室则含两对天冬氨酸(D92/D289和D99/D296),可能作为质子耦合位点。
独特的底物识别机制
与已知转运阳离子或芳香族底物的MATE蛋白不同,HvAACT1特异性识别三价阴离子柠檬酸(citrate3-)。分子动力学模拟显示,内向构象中TM1和TM7的弯曲可扩大结合腔,使三个碱性残基协同结合柠檬酸。功能实验证实,上述碱性残基突变体(如K126A)虽保留部分活性,但转运效率显著降低,暗示其可能通过二价柠檬酸(Hcitrate2-)实现替代转运。
质子耦合与构象转换
HvAACT1的N-叶腔室结构与原核DinF亚家族(如PfMATE)高度相似:D99TM1/D296TM5对应PfMATE的D41/D184质子结合对。独特的氢键网络(含R255TM4和H314TM6)将质子化事件传递至C-叶,触发TM1在P84/P93处的弯曲,驱动构象转换。双Asp突变体(D92A/D99A)的残余活性提示可能存在Na+/K+辅助耦合机制,与高粱SbMATE的离子多效性一致。
进化与农业应用
系统发育分析将柠檬酸MATE归类为DinF样羧酸转运eMATE(CAT-eMATE),与NorM样eMATE(如拟南芥AtDTX14)的C-叶质子耦合机制截然不同。大麦栽培种中1-kb转座子插入可上调HvAACT1表达,使酸性土壤产量提升2-3倍,凸显其育种价值。与铝激活型阴离子通道(ALMT1)相比,HvAACT1采用“转运体”而非“通道”机制,更适配不对称柠檬酸分子的定向外排。
技术突破与局限
研究通过截短N端(Δ1-56)和胞内环(Δ153-199)获得稳定结晶构象HvAACT1cryst,其功能与野生型等效。AlphaFold2预测的内向构象与晶体结构RMSD达5.1 ?,但TM1/TM7弯曲角的差异(30°-35°)为交替存取机制提供佐证。未观测到底物电子密度可能因外向构象中柠檬酸快速释放,而MD模拟中 citrate3-的多次结合事件支持结合位点假说。
未来展望
该研究为作物耐铝基因设计提供靶点,如改造质子结合残基(D99/D296)或引入转座子增强子。DinF与CAT-eMATE的进化关联暗示MATE家族可能起源于脂质转运祖先,其功能多样性远超当前认知。后续需解析底物结合态及铝激活构象,以完善阴离子转运的动力学模型。
生物通微信公众号
知名企业招聘