全基因组单核苷酸多态性分析与高分辨率熔解曲线技术鉴别鳗弧菌和鱼害爱德华氏菌

为解决水产养殖中爱德华氏菌病病原体鉴别难题，研究人员通过全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析和高分辨率熔解曲线(HRM)技术，成功区分鳗弧菌(Edwardsiella anguillarum)和鱼害爱德华氏菌(E. piscicida)。研究鉴定出artI、dnaK等8个关键差异基因，建立基于hlyB基因的HRM快速鉴别方法，为水产病原体监测提供高效技术手段。

　　

这项研究开创性地将全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析与高分辨率熔解曲线(High-Resolution Melting, HRM)技术相结合，对引发鱼类爱德华氏菌病的两种近缘病原体——鳗弧菌(Edwardsiella anguillarum)和鱼害爱德华氏菌(E. piscicida)进行精准鉴别。

通过全基因组SNP扫描，研究人员构建了包含鱼害爱德华氏菌、鳗弧菌及鲶鱼爱德华氏菌(E. ictaluri)的系统发育树，发现各菌种SNP特征存在显著聚类现象。深入分析锁定8个关键差异基因：artI、dnaK、hlyB、ubiB、hutW、ydgD、甲基趋化蛋白基因(MCP)和鞭毛蛋白基因(fliC)，其中溶血素基因hlyB展现出最优鉴别效能。

基于这些遗传标记设计的特异性引物，配合实时荧光定量PCR与HRM技术，成功建立快速鉴别体系。HRM曲线显示两种病原体具有特征性熔解温度(T_m)峰值，对原鉴定为迟缓爱德华氏菌(E. tarda)的37株分离株进行复核，准确区分出35株鳗弧菌和2株鱼害爱德华氏菌。

该研究不仅为水产养殖病原监测提供了一种经济高效的分子检测方案，更揭示了爱德华氏菌属种间遗传变异规律，对理解病原-宿主特异性互作机制具有重要启示。