尼塞韦单抗免疫预防下加泰罗尼亚地区人呼吸道合胞病毒(HRSV)的进化动态与抗原逃逸突变研究

为评估单克隆抗体尼塞韦单抗(nirsevimab)对HRSV的进化压力，西班牙Vall d'Hebron研究所团队通过全基因组测序(WGS)分析了2023-2024年免疫与非免疫人群的病毒变异特征。研究发现HRSV-B在免疫压力下呈现更高的遗传多样性，并鉴定出?抗原位点特异性突变K209E(HRSV-A)和K68E(HRSV-B)，为全球首个真实世界数据驱动的免疫逃逸监测研究，发表于《Journal of Infection》。

　　

人呼吸道合胞病毒(HRSV)是导致婴幼儿下呼吸道感染的主要病原体，全球每年造成约140万例住院病例。尽管单克隆抗体尼塞韦单抗(nirsevimab)的上市为预防带来了突破，但其靶向的F蛋白抗原位点?的高保守性是否会在免疫压力下发生变异，成为关乎临床有效性的关键科学问题。

西班牙巴塞罗那Vall d'Hebron大学医院研究所（Vall d'Hebron Institut de Recerca, VHIR）的研究团队开展了这项开创性研究。通过加泰罗尼亚地区哨点监测网络(SIVIC)和三家医院收集的样本，研究人员采用全基因组测序技术，对比分析了免疫与非免疫人群感染病毒的遗传特征。研究首次揭示了在真实世界大规模免疫背景下，HRSV展现出的独特进化轨迹。

关键技术包括：1) 基于四重覆盖PCR的全基因组扩增策略；2) Illumina双平台测序与多步骤质控流程；3) 最小等位频率0.01的群体遗传学分析；4) Tajima's D检验和dN/dS比值的选择压力评估。

【样本特征】

研究纳入251例非免疫者全基因组数据(HRSV-A 165例，HRSV-B 86例)和79例免疫者数据。免疫组覆盖率达92%，代表欧洲首个完整免疫季的病毒进化基线。

【谱系分布】

Nextstrain分型显示免疫组与非免疫组的谱系构成无显著差异。HRSV-A以A.D.3(28%)为主，HRSV-B中B.D.E.1占72%，提示当前免疫策略尚未导致优势株更替。

【遗传多样性】

HRSV-B免疫组在P基因(p=0.0404)和F蛋白HRA区域(p=0.0301)呈现更高核苷酸多样性，而HRSV-A两组间无差异。特别值得注意的是，?抗原位点在HRSV-B免疫组的多样性升高37%，暗示该亚型可能更易产生免疫逃逸突变。

【抗原位点突变】

发现4个?位点关键突变：

1. HRSV-A的K209E为免疫组独有，该位点与nirsevimab形成盐桥；

2. HRSV-B的K68E同样仅见于免疫组，体外研究显示该突变可使中和效价降低5倍；

3. 天然存在的R209Q在免疫组检出率翻倍(28.57% vs 15%)；

4. S211N在两组均高频存在(82% vs 71.43%)。

【进化选择压力】

Tajima's D分析显示免疫组选择压力向中性偏移，HRSV-B的NS2、N、SH等蛋白在非免疫组呈显著负选择(p<0.05)，而免疫组该现象消失。dN/dS比值进一步证实HRSV-A的G蛋白314位点存在正选择，可能反映免疫压力下的适应性进化。

这项研究首次系统揭示了nirsevimab免疫对HRSV自然进化的影响。特别值得关注的是，HRSV-B表现出更强的遗传可塑性，其P基因和抗原位点的多样性增加可能成为未来监测重点。发现的K209E和K68E突变虽当前频率较低，但因涉及抗体结合关键位点，需警惕其通过阳性选择扩散的风险。

研究建立的实时基因组监测框架，为全球HRSV免疫策略调整提供了关键数据支持。随着更多靶向F蛋白的单抗(如clesrovimab)进入临床，这种多表位监测模式将成为评估交叉耐药的有力工具。该成果也提示，在HRSV-B优势流行季需加强哨点监测，以早期发现可能影响免疫效果的病毒变异。