揭示谷氨酸开关机制:植物H+-焦磷酸酶质子转运的动态耦合研究

【字体: 时间:2025年08月07日 来源:Biophysical Journal 3.1

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  来自国内的研究人员通过恒定pH分子动力学(CpHMD)和经典分子动力学(MD)模拟,揭示了Vigna radiata H+-焦磷酸酶(VrH+-PPase)中质子转运的双重机制。研究发现K742去质子化与E301穿透疏水门的动态耦合,提出"谷氨酸开关"调控假说,为植物H+-PPases的质子跨膜转运机制提供原子尺度见解。

  

膜结合焦磷酸酶(M-PPases)作为生物能量转换的关键分子机器,通过水解焦磷酸(PPi)驱动H+/Na+跨膜转运。在绿豆(Vigna radiata)H+-转运焦磷酸酶(VrH+-PPase)中,质子传递展现出精妙的双重舞蹈:"结合变化"机制中PPi结合触发质子位移,而"格罗特斯链"机制则描绘了质子沿离子门(R242/D294/K742/E301)、疏水门(L232/A305/L555/V746)和出口通道的跳跃轨迹。

最新模拟研究捕捉到令人惊叹的分子芭蕾:当PPi结合时,K742优雅地脱下质子外衣(去质子化),可能扮演着内部质子供体的角色。与此同时,E301如同突破防线的先锋,穿透疏水门并构建出亲水通道。PPi水解后,D294接受新生质子并引发连锁反应——R242化作正电插销锁定D294质子化状态,而E301则回弹关闭疏水门。这种被称为"谷氨酸开关"的动态调控,在植物H+-PPases中展现出惊人的保守性。

研究揭示植物H+-PPases质子转运的精妙时空调控:PPi结合状态依赖赖氨酸(K742)去质子化启动,水解阶段通过天冬氨酸(D294)质子化推进,而谷氨酸(E301)则化身分子指挥家,通过构象变化精准调控疏水门的开合节奏。这些发现为理解植物能量转换的分子机制提供了全新视角。

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