人源tRNAArg UCG同解码器实现高保真无义突变抑制:在额颞叶痴呆模型中的治疗潜力

【字体: 时间:2025年08月07日 来源:Nucleic Acids Research 13.1

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  本研究针对由无义突变(PTCs)引发的遗传疾病(如额颞叶痴呆FTD),开发了基于人源tRNAArg UCG同解码器的无义抑制系统。通过双荧光报告基因和tRNA测序(OTTR-seq)技术,研究人员筛选出高效抑制UGA终止密码子的tRNAArg UCA变体,在神经母细胞瘤模型中成功恢复突变颗粒蛋白前体(PGRN R493X)72%的表达水平,且氨基酸插入保真度显著优于氨基糖苷类药物G418。该研究为精准治疗11%由无义突变导致的遗传病提供了新策略。

  

遗传密码中的"句号"错误——无义突变导致的蛋白质合成提前终止,是11%人类遗传疾病的罪魁祸首。其中精氨酸密码子CGA突变为终止密码子UGA(RArg→XUGA)占比最高(21%),可引发囊性纤维化、杜氏肌营养不良等致命疾病。在神经退行性疾病领域,颗粒蛋白前体(progranulin, PGRN)基因的R493X突变导致其功能缺失,与22%家族性额颞叶痴呆(FTD)病例相关。传统氨基糖苷类药物虽能诱导终止密码子通读(readthrough),但存在效率低、毒性高且氨基酸插入错误等问题。

加拿大西安大略大学(The University of Western Ontario)与加州大学圣克鲁兹分校的研究团队在《Nucleic Acids Research》发表突破性研究。他们利用人源tRNAArg UCG同解码器(isodecoder)开发出高保真无义抑制系统,通过基因工程改造获得能精准识别UGA终止密码子的tRNAArg UCA变体。研究采用双荧光报告基因(eGFP-mCherry)实时监测活细胞无义抑制效率,结合tRNA测序(OTTR-seq)定量分析 suppressor tRNA表达水平,并通过Western blot和质谱(LC-MS/MS)验证颗粒蛋白前体R493X突变体的通读保真度。

tRNAArg UCG同解码器产生差异化的无义抑制水平

研究人员构建了包含6种人源tRNAArg UCG基因变体的G36A突变体(tRNAArg UCA),发现TCG-3-1变体在HEK 293T和SH-SY5Y细胞中分别实现35.7%和42.4%的UGA通读效率。值得注意的是,天然存在B-box启动子突变(C61T)的TCG-6-1变体完全丧失抑制功能,印证了tRNA表达调控的重要性。

tRNA表达量与抑制效率正相关

OTTR-seq显示转染的tRNAArg UCA 3-1占tRNAArg UCG同解码器池的58%(占总tRNAArg的5.6%),其表达量是4-1变体的2.1倍,抑制效率相应提高1.8倍。转染后细胞tRNA组(tRNAome)保持稳定,仅tRNAAsn GUU-8等少数tRNA出现2倍以上表达变化。

修饰谱分析揭示功能调控机制

m1G37(1-甲基鸟苷)修饰水平在高效抑制的3-1变体中显著升高(64%→69%),而m22G26(N2-二甲基鸟苷)和m1A58(1-甲基腺苷)修饰下降,提示特定碱基修饰影响tRNA稳定性与功能。

FTD模型中的治疗潜力验证

在表达PGRN R493X-GFP的SH-SY5Y细胞中,tRNAArg UCA 3-1实现72%的颗粒蛋白恢复,显著优于G418(19%)。质谱分析证实tRNA介导的通读100%插入精氨酸,而G418导致23%的半胱氨酸错误插入。细胞增殖实验(CCK8)显示tRNA处理组生长正常,而G418(2 mg/mL)显著抑制细胞活力。

这项研究开创性地证明:人源tRNA变体可精准修复致病性无义突变,其效率、保真度和生物相容性均优于传统药物。特别是对FTD相关PGRN R493X突变的成功校正,为神经退行性疾病的基因治疗提供了新范式。该技术未来可通过AAV载体递送,实现组织特异性表达,避免对天然终止密码子的脱靶效应。研究还揭示tRNA同解码器的序列差异、表达调控和转录后修饰共同决定其抑制效能,为优化治疗性tRNA设计提供了分子蓝图。

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