LGI1抗体相关脑炎的肠道微生物组特征：揭示神经炎症与菌群失衡的潜在关联

这篇研究通过宏基因组测序技术揭示了LGI1抗体脑炎（LGI1-Ab-E）患者肠道菌群的组成和功能变化，发现其Firmicutes/Bacteroidetes（F/B）比值显著降低，且与HLA-DRB1 * 07:01等位基因剂量相关。研究进一步表明菌群功能改变可能导致短链脂肪酸（SCFA）生成减少，提示肠道微生物组可能通过调节神经炎症参与疾病发生。

　　

摘要

LGI1抗体脑炎（LGI1-Ab-E）是一种以靶向神经元表面蛋白的自身抗体为特征的神经炎症性疾病，其病因尚不明确。本研究通过分析42例LGI1-Ab-E患者和27例匹配对照的肠道微生物组，揭示了菌群组成和功能的特异性改变，为疾病机制提供了新视角。

方法

采用宏基因组鸟枪测序技术，结合Kraken2和Bracken分类工具，对粪便样本进行物种和功能注释。通过线性判别分析（LDA）和KEGG通路分析比较组间差异，并评估HLA基因型与菌群特征的关联。

结果

菌群组成变化：

1. LGI1-Ab-E患者肠道菌群中Firmicutes（现称Bacillota）与Bacteroidetes的比值（F/B）显著降低（病例中位数1.13 vs 对照2.28，p=0.030），且与HLA-DRB1 * 07:01等位基因剂量呈负相关（β=?2.53，p=0.0013）。

2. 病例组中口腔和小肠来源菌属（如Streptococcus、Veillonella）富集，而抗炎相关菌种Bifidobacterium longum在对照组显著增多。

功能差异：

1. 病例组中辅酶A（CoA）生物合成和短链脂肪酸（SCFA）生成相关KEGG模块（如M00120）显著减少，提示神经保护性代谢物水平下降。

2. 未发现LGI1蛋白的细菌同源物在患者菌群中富集的证据。

讨论

研究首次提出LGI1-Ab-E的肠道菌群特征可能通过两种途径参与疾病：

1. 遗传-环境交互：HLA风险等位基因携带者的菌群失衡（如F/B比值降低）可能促进炎症状态；

2. 功能失调：SCFA生成减少可能削弱肠屏障功能，加剧神经炎症。

局限性与展望

样本量较小（n=42）和病例慢性期偏倚可能影响结果普适性。未来需扩大队列并纵向采样，以明确菌群变化是病因还是疾病后果。此外，菌群调控（如SCFA补充）或为潜在干预策略。

关键图表提示

• 图1：病例与对照的菌群组成对比显示Bacteroidetes（橙色）比例升高。

• 表2：差异菌种列表（如Streptococcus parasanguinis在病例中富集，p=0.0055）。

• 图2：LDA分析突出B. longum等保护性菌种在对照组的富集（LDA得分>3）。

（注：全文数据均基于原文统计结果，未添加主观推断）