综述：光谱法及其在RNA结合蛋白检测中的应用：进展、技术与挑战

这篇综述系统阐述了光谱法（MS）在RNA结合蛋白（RBP）研究中的技术原理与应用进展，重点介绍了质谱（如MALDI-TOF MS）和拉曼光谱等技术在长链非编码RNA（lncRNA）互作蛋白鉴定、翻译后修饰（PTM）分析中的突破，并探讨了lncRNA在癌症（如HCC、NSCLC）、代谢疾病中的分子机制与临床转化潜力。

　　

光谱法：光与物质的解码器

光谱法通过分析电磁辐射与物质的相互作用，揭示样品的化学组成与结构特性。从紫外-可见光谱到傅里叶变换红外光谱（FTIR），这些技术已广泛应用于环境污染物检测、蛋白质构象分析等领域。质谱（MS）作为核心工具，通过电离分子并按质荷比（m/z）分离，实现了对生物大分子的精准鉴定。

质谱技术的四大金刚

磁扇形质谱利用磁场偏转离子，适合小分子分析；四极杆质谱通过电场筛选离子，兼具速度与灵敏度；离子阱质谱可捕获并累积离子，提升检测限；飞行时间质谱（TOF MS）则凭借超宽质量范围，成为蛋白质组学的利器。其中，基质辅助激光解吸电离（MALDI）与TOF联用，通过激光激发样品-基质共结晶，实现了lncRNA结合蛋白的高通量鉴定。

lncRNA：基因组暗物质的调控密码

占人类转录本80%的lncRNA（>200 nt）通过信号、诱饵、引导和支架四种机制调控基因表达。例如：

• 信号分子：COLDAIR响应低温，通过PRC2复合体启动开花程序；

• 蛋白稳定剂：肝癌中的TGLC15结合转录因子Sox4，抑制其蛋白酶体降解；

• 代谢开关：糖尿病肾病中CYP4B1-PS1-001通过泛素化途径调控核仁蛋白NCL。

癌症中的lncRNA-蛋白互作网络

RNA pulldown联合质谱技术揭示了多种癌症关键靶点：

• 胆囊癌：GBCDRlnc1通过抑制ATG5-ATG12自噬通路促进化疗耐药；

• 三阴性乳腺癌：OLBC15加速ZNF326蛋白降解，驱动肿瘤转移；

• 非小细胞肺癌：LNBC3稳定癌蛋白BCL6，LINC01833则通过m⁶A修饰调控METTL3-HNRNPA2B1复合体功能。

挑战与未来

尽管MALDI-TOF MS在微生物鉴定中已实现临床转化，但lncRNA研究仍面临低丰度、技术灵敏度等瓶颈。随着互作组学与单细胞技术的发展，光谱法将更深入揭示lncRNA在疾病中的动态调控网络，为精准医疗提供新靶点。