蓝鲨(Prionace glauca)基因组特征与微卫星全基因组分布模式解析及其保护遗传学意义

来自中国舟山的研究团队针对全球鲨鱼鳍贸易主要目标物种——近危(NT)蓝鲨(Prionace glauca)基因组数据匮乏的现状，开展全基因组测序与微卫星(SSR)分布特征研究。测得该物种基因组大小约3Gb，杂合率0.54%，重复序列占比65.06%，组装指标Contig N50达2357bp；鉴定出444,196个SSR位点(密度172.23 loci/Mb)，其中二核苷酸重复占比50.34%，C/G型单核苷酸(27.57%)与AC/GT型二核苷酸(26.22%)为优势类型。该成果为蓝鲨高质量基因组图谱构建提供基础数据，SSR标记库可助力物种保护遗传学与进化生物学研究。

　　

在舟山海域采集的蓝鲨(Prionace glauca)样本揭示了有趣的基因组特征：这个被IUCN红色名录评估为"近危(NT)"的物种拥有约3Gb的庞大基因组，其0.54%的杂合率与高达65.06%的重复序列比例暗示着复杂的进化历程。研究人员通过初步组装获得Contig N50 2357bp、Scaffold N50 3917bp的基因组草图，从中挖掘出444,196个闪闪发光的微卫星(SSR)位点——相当于每Mb序列藏着172.23个"基因密码重复单元"。

特别引人注目的是二核苷酸重复的"半壁江山"现象(50.34%)，而C/G单核苷酸(27.57%)和AC/GT二核苷酸(26.22%)则像基因组中的"高频词汇"般占据主导地位。这些散布在蓝鲨基因组中的SSR标记，就像生物学家手中的分子探针，将为揭开这个濒危物种的遗传多样性保护、种群演化历史等科学谜题提供关键线索。