揭示不同施肥系统下韭葱(Allium ampeloprasum)根际微生物组及其功能数据集

为解决农业可持续性中微生物组功能与施肥系统的关联问题，研究人员通过宏基因组测序技术分析了韭葱根际微生物组在化学肥料(G1)、生物肥料(G2)及未耕作土壤(G3)中的差异。结果表明，生物肥料显著富集了以细菌为主的微生物群落及代谢功能，为土壤健康提升提供了科学依据。相关数据已公开于NCBI-SRA（SRP537120-188）。

　　

韭葱(Allium ampeloprasum)作为富含维生素和膳食纤维的重要蔬菜，其生长高度依赖根际微生物组的调控。然而，化学肥料的长期使用可能导致土壤微生态失衡，而生物肥料对微生物功能的影响尚不明确。这一空白促使南非西北大学(North-West University)的Oluhukola Oluranti Babalola团队通过宏基因组学手段，系统解析了不同施肥系统下韭葱根际微生物组的结构与功能差异。

研究采用Illumina NovaSeq X Plus平台对12份土壤样本（化学肥料、生物肥料及未耕作土壤各4重复）进行全基因组测序，结合Fastp数据清洗、Bowtie2去宿主污染、MEGAHIT组装及DIAMOND数据库注释，构建了非冗余基因目录。

微生物群落结构差异

生物肥料处理组(G2)的微生物多样性显著高于化学肥料组(G1)，且以变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为优势菌群，而化学肥料组则表现出厚壁菌门(Firmicutes)的富集。

功能代谢特征

KEGG注释显示，G2组中氨基酸代谢、辅因子合成等通路丰度更高，而G1组中抗生素耐药基因相对增多，暗示化学肥料可能诱导微生物应激响应。

讨论与意义

该研究首次揭示了生物肥料通过调控根际微生物组代谢网络（如氮循环相关基因的富集）促进土壤健康的机制，为减少农业对化学肥料的依赖提供了理论支持。数据已公开于NCBI-SRA（SRP537120-188），为后续微生物组工程应用奠定基础。论文发表于《BMC Genomic Data》。