活细胞RNA-蛋白质互作全景测绘:TAPRIP技术揭示circRNA调控及rG4结合蛋白新机制

【字体: 时间:2025年08月08日 来源:Nature Chemical Biology 13.7

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  来自国内的研究团队开发了名为TAPRIP(TurboID-assisted proximity labeling of targeted RNA-interacting proteins)的邻近标记技术,通过将miniTurbo酶与RNA靶向元件CIRTS3结合,成功绘制了mCherry环状RNA(circRNA)和BCL2 RNA G-四链体(rG4)的蛋白质互作网络。研究发现HNRNPK通过结合内含子调控circRNA表达,RBM12则通过识别rG4结构促进BCL2翻译并在急性髓系白血病中发挥关键作用。该技术为活细胞特定RNA序列的蛋白质互作研究提供了新范式。

  

科研团队创新性地开发了TurboID辅助的靶向RNA互作蛋白邻近标记技术(TAPRIP),将高效标记酶miniTurbo与定制化RNA靶向模块CIRTS3巧妙融合,实现了活细胞内特定RNA结合蛋白的动态捕获。通过该技术系统解析了mCherry环状RNA(circRNA)的互作组,揭示核不均一核糖核蛋白K(HNRNPK)通过结合侧翼内含子调控circRNA生物发生的关键机制。更令人振奋的是,针对原癌基因BCL2的RNA G-四链体(rG4)特殊结构,发现RNA结合基序蛋白12(RBM12)如同"分子桥梁"般特异性识别rG4并招募核糖体,显著增强BCL2的翻译效率。在急性髓系白血病细胞系MOLM-13、MV4-11和THP-1中,RBM12的敲除导致肿瘤细胞增殖和克隆形成能力断崖式下降,为血液肿瘤治疗提供了新的潜在靶点。这项研究犹如给RNA研究领域装上了"蛋白质雷达",为揭示RNA调控网络的分子密码开辟了新途径。

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