单基因与多基因panel测序在晚期HR+/HER2-乳腺癌中的临床价值比较：ctDNA分析指导精准治疗的突破性进展

本研究针对HR+/HER2-乳腺癌治疗中ctDNA检测方法的选择难题，通过前瞻性多中心研究对比了SiMSen-Seq单基因检测与AVENIO多基因panel的性能。结果显示两者PIK3CA突变检测一致性达92.6%，而多基因panel额外检出ESR1(17.5%)和PI3K通路(40.6%)等可干预靶点，结合mFAST-SeqS肿瘤分数评估显著提升阴性结果解读可靠性，为临床实践提供更全面的分子分型方案。

　　

激素受体阳性(HR+)/HER2阴性(HER2-)乳腺癌占所有乳腺癌的70%，尽管CDK4/6抑制剂(CDK4/6i)显著改善了患者预后，但治疗耐药仍是重大挑战。近年来，针对PI3KCA突变(如alpelisib)、ESR1突变(如elacestrant)的靶向药物陆续问世，而ctDNA检测作为无创监测工具，其检测方法的标准化和临床实用性亟待评估。目前单基因检测与多基因panel的优劣缺乏头对头比较，且全球检测可及性存在显著差异，这直接影响了精准医疗策略的实施。

Medical University of Graz等机构的研究人员通过前瞻性多中心研究，对161份来自146例HR+/HER2-晚期乳腺癌患者的血浆样本进行三重检测：采用SiMSen-Seq(SSS)检测PIK3CA热点突变、AVENIO ctDNA Expanded panel(77基因)进行广谱分析，以及mFAST-SeqS评估肿瘤分数。研究发现发表于《npj Breast Cancer》，揭示了多基因检测在指导精准治疗中的独特价值。

关键技术包括：1)前瞻性收集96例一线和52例二线治疗前血浆样本；2)SSS超高灵敏度检测(灵敏度0.25%)；3)AVENIO panel覆盖关键通路基因；4)mFAST-SeqS通过基因组z-score量化肿瘤分数；5)混合效应模型处理重复测量数据。

结果

患者特征和血浆样本

队列中位年龄64.9岁，39.8%样本检测到ctDNA。二线治疗样本的z-score显著高于一线(增加10.1，p=0.019)，提示晚期疾病肿瘤负荷更高。

PIK3CA突变检测的一致性

两种方法对PIK3CA检测的总体一致性达92.6%，阳性符合率88.7%，阴性符合率94.3%。Bland-Altman分析显示VAF测量差异仅0.62%，线性回归系数0.94(p<0.001)。但AVENIO额外检出19%的PIK3CA突变，其中9.4%符合INAVO120试验入组标准。

阴性液体活检结果的验证

结合z-score≥3或hVAF≥1%标准，使52.7%的PIK3CA野生型样本得以准确分类。在z-score<3的样本中，44.9%通过hVAF被重新判定为"真阴性"，显著提升结果可靠性。

AVENIO检测的基因组图谱

66.4%样本检出致病突变，除PIK3CA(36.8%)外，ESR1(17.5%)、TP53(12.6%)和PI3K通路变异(40.6%)最为常见。二线治疗样本中ESR1突变率显著升高(p=0.002)，且多克隆突变更频繁，提示治疗压力下的克隆进化。

讨论

该研究首次系统比较了单基因与多基因ctDNA检测在HR+/HER2-乳腺癌中的临床效用。虽然SSS对PIK3CA检测表现出优异性能，但AVENIO panel通过三大优势改变临床实践：1)扩大治疗机会，识别更多符合INAVO120试验标准的患者；2)揭示ESR1等耐药机制，指导SERD药物选择；3)结合肿瘤分数优化阴性结果解读。值得注意的是，PI3K通路变异在40.6%患者中被检出，凸显PI3K/AKT/mTOR抑制剂联合治疗的潜在价值。

研究同时揭示了技术局限性：AVENIO panel未覆盖CCND1/FGFR1等耐药相关扩增基因，且缺乏BRCA1/2大片段缺失检测能力。未来需要整合更全面的基因组特征（如HRD评分）和表观遗传标记，以应对快速发展的靶向治疗格局。这些发现为建立国际标准化ctDNA检测指南提供了关键证据，尤其对资源不均衡地区的检测策略选择具有指导意义。