家禽垫料细菌群落时序演变及其生物肥料潜力与公共卫生风险研究

来自印度泰米尔纳德邦Marakkanam的研究人员通过16S rRNA纳米孔测序技术，解析了商业肉鸡养殖场六周饲养周期中垫料微生物群的动态变化。研究发现垫料中不仅存在参与氮磷硫循环的功能菌株（如Nitrosomonas eutropha），还检出结核分枝杆菌等致病菌，为开发生物肥料与防控病原传播提供了关键数据。

　　

这项突破性研究揭示了肉鸡养殖场垫料微生物群的动态演替规律。采用牛津纳米孔16S rRNA测序技术，科研人员追踪了印度泰米尔纳德邦某农场六周饲养期内垫料样本(P1-P6)的菌群更迭：首周鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium sp. 21)占比高达53%，随后两栖芽孢杆菌(Amphibacillus xylanus)和海洋单胞菌(Oceanimonas sp. GK1)相继主导，末期海洋单胞菌再度占据半壁江山。

研究亮点在于同时发现两类关键微生物：一方面检测到参与氮循环的亚硝化单胞菌(Nitrosomonas eutropha)、磷循环的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)及硫循环的嗜酸硫杆菌(Acidithiobacillus caldus)，证实垫料作为生物肥料的巨大潜力；另一方面检出的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)、肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)等病原体则敲响公共卫生警钟。该成果为优化禽类废弃物资源化利用策略提供了重要科学依据，同时警示需建立病原体消杀标准以保障生物肥料安全性。