综述:基于CRISPR/Cas和Argonaute核酸酶的病毒检测技术

【字体: 时间:2025年08月08日 来源:Clinica Chimica Acta 2.9

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  这篇综述系统阐述了CRISPR/Cas(成簇规律间隔短回文重复序列/CRISPR相关蛋白)和Argonaute(Ago)核酸酶在病毒检测中的突破性应用。作者详细比较了Cas9、Cas12、Cas13与Ago系统的分子机制,重点介绍了DETECTR(DNA内切酶靶向CRISPR反式报告系统)、SHERLOCKv2(高灵敏度酶报告解锁技术)等前沿方法在单/多重病毒检测中的优势,指出这些技术可实现1拷贝/mL的灵敏度(无需复杂设备),为传染病精准防控提供了新范式。

  

病毒检测新纪元:CRISPR与Ago核酸酶的精准狙击战

CRISPR/Cas系统:细菌免疫武器的跨界应用

CRISPR/Cas系统本是原核生物的"分子卫士",其Cas9、Cas12、Cas13三类效应蛋白各具特色:Cas9依赖PAM序列实现DNA双链切割;Cas12在识别靶标后会爆发"附带切割"活性,可无差别降解周边单链DNA;Cas13则专攻RNA,其"反式切割"能力被改造为高灵敏度信号放大器。这些特性使其突破基因编辑领域,在新冠病毒(SARS-CoV-2)、埃博拉病毒(EBOV)等检测中大放异彩。

Argonaute:古菌防御系统的逆袭

与CRISPR系统不同,Ago蛋白利用DNA/RNA引导链进行"接力式"切割——每次切割产生的片段又能作为新引导链,形成级联反应。这种特性在PfAgo介导的核酸检测(PAND)中表现惊艳,可实现5重病毒同步检测。

单病毒检测的极限挑战

传统PCR需要2-4小时才能完成的检测,新技术可压缩至1小时内:

  • DACD/RACD:利用Cas9反式切割活性,首次实现DNA/RNA双激活检测

  • DETECTR:基于Cas12的系统灵敏度达阿摩尔级(10-18M)

  • 量子点报告系统:CFNS技术对SARS-CoV-2的检测限低至1拷贝/mL

  • 手机直读检测:无需扩增即可检出31拷贝/μL样本,适合基层应用

多重检测的集成革命

面对复杂感染场景,多重检测技术突破样本限制:

  • MiCaR微流控芯片:整合CRISPR/Cas12a与多重重组酶聚合酶扩增(RPA),实现30种病原体空间区分检测

  • SHERLOCKv2:四色荧光系统同步鉴别寨卡病毒(ZIKV)、登革热病毒(DENV)等近缘病毒

  • CARMEN技术:通过微滴编码支持100+靶标检测,堪称"病毒条形码扫描仪"

挑战与未来:精准诊断的进化之路

当前技术仍面临PAM序列限制、核酸提取耗时、酶稳定性等瓶颈。未来发展方向包括:

  1. 开发PAM非依赖型Cas变体

  2. 构建室温稳定的冻干试剂

  3. 人工智能辅助crRNA设计

  4. CRISPR-Ago联用系统提升特异性

这些创新技术正推动分子诊断从实验室走向社区,为应对新发传染病提供"快、准、省"的解决方案。正如作者所言,当人类与病毒的博弈进入新阶段,这些源自细菌和古菌的防御武器,或将成为守护公共卫生安全的"分子哨兵"。

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