量子扩张卷积循环网络(QDCRNet)在基因表达数据病毒检测中的创新应用

【字体: 时间:2025年08月08日 来源:Computational Biology and Chemistry 3.1

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  本文推荐:研究者提出量子扩张卷积循环网络(QDCRNet),整合量子扩张卷积神经网络(QDCNN)和深度循环神经网络(DRNN),通过Box-Cox变换和高尔距离(Gower distance)特征选择,实现病毒检测准确率90.8%。该模型突破传统方法在低表达病毒识别和变异株适应性上的局限,为基因表达数据驱动的精准诊断提供新范式。

  

亮点

病毒感染的快速传播特性对检测技术提出严峻挑战。本研究创新性地提出量子扩张卷积循环网络(QDCRNet),通过融合量子计算优势与深度学习架构,显著提升基因表达数据中病毒特征的识别能力。

文献综述

Aher等人开发的骑手鸡优化循环神经网络(RCO-RNN)虽能快速降维,但缺乏有效的特征筛选机制;Abdel Samee的深度神经网络(DNN)在关键基因识别中表现优异,但对新兴病毒变种的适应性不足。

方法创新

QDCRNet采用三阶段流程:

  1. 数据预处理:Box-Cox变换消除基因表达数据偏态

  2. 特征工程:结合高尔距离与互信息筛选病毒敏感区域

  3. 量子-经典混合建模:QDCNN捕获空间特征,DRNN解析时序模式

性能验证

在包含COVID-19等病原体的数据集上,模型展现卓越性能:

  • 准确率90.8%

  • 灵敏度90.5%(有效识别低载量样本)

  • 特异性90.4%(精准区分相似症状病毒)

结论

该框架突破传统PCR检测的局限性,其量子-经典混合架构为应对病毒快速进化提供了可扩展解决方案。源代码已开源(GitHub),推动AI在病原体检测领域的临床应用。

贡献声明

通讯作者Iyswarya负责研究监督,第一作者Karthi完成算法开发与论文撰写,团队来自印度安娜大学圣约瑟夫工程学院。

利益冲突

作者声明无任何可能影响研究客观性的财务或个人关系。

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