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H3K4me3通过调控RSPO3转录影响毛囊形态发生与发育的表观遗传机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月09日 来源:Epigenetics & Chromatin 3.5
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本研究针对绒山羊毛囊发育的表观遗传调控机制,通过CUT&Tag技术绘制了DPCs(真皮乳头细胞)中H3K4me3修饰图谱,结合RNA-seq筛选出关键靶基因RSPO3。研究发现H3K4me3通过激活RSPO3转录促进DPCs增殖并抑制凋亡,进而增强Wnt/β-catenin通路活性,为毛囊发育的分子机制提供了新见解。
毛囊发育是哺乳动物皮肤附属器官形成的关键过程,其形态发生依赖于表皮与真皮间的精密对话。其中真皮乳头细胞(DPCs)作为毛囊基底的"信号中枢",通过分泌活性分子调控毛囊周期。然而,DPCs中表观遗传修饰如何影响毛囊发育仍存在认知空白。组蛋白H3第4位赖氨酸三甲基化(H3K4me3)作为典型的转录激活标记,在基因表达调控中发挥重要作用,但其在绒山羊DPCs中的分布特征及功能机制尚未阐明。
西北农林科技大学的研究团队在《Epigenetics》发表的研究中,首次绘制了陕北白绒山羊DPCs全基因组H3K4me3修饰图谱。通过整合CUT&Tag测序与转录组数据,发现H3K4me3通过调控R-spondin 3(RSPO3)基因的表达,激活Wnt/β-catenin信号通路,进而促进DPCs增殖并抑制凋亡。这一发现为毛囊发育的表观遗传调控提供了新视角。
研究采用CUT&Tag技术绘制H3K4me3全基因组图谱,结合胚胎期皮肤RNA-seq数据筛选差异基因;使用小分子抑制剂BCL-121和激动剂PBIT调控H3K4me3水平;构建RSPO3腺病毒过表达载体和siRNA干扰系统;通过CCK-8、EdU、Western blot等技术验证功能。
H3K4me3在DPCs基因组中的分布特征
CUT&Tag测序显示H3K4me3修饰主要富集在转录起始位点(TSS)附近,呈染色体广谱分布。Motif分析发现IRF2等转录因子结合位点显著富集,提示H3K4me3可能通过招募特定转录因子调控基因表达。
H3K4me3修饰对DPCs增殖及Wnt通路的影响
功能实验表明,提高H3K4me3水平可显著增强DPCs增殖能力,上调Wnt通路相关基因(CTNNB1、TCF4等)表达。免疫荧光证实H3K4me3促进β-catenin核转位,激活经典Wnt信号。
胚胎发育阶段H3K4me3调控差异基因鉴定
整合分析发现14,741个H3K4me3调控基因,其中RSPO3在器官形成期(E90)显著高表达。单细胞测序验证RSPO3特异性富集于DPCs,Western blot显示其表达受H3K4me3正向调控。
RSPO3在DPCs中的功能验证
过表达RSPO3显著促进DPCs增殖(CCND1、PCNA上调),抑制凋亡(BCL2上调/CASP3下调),并激活Wnt通路。相反,siRNA干扰导致增殖减弱、凋亡增加,证实RSPO3是H3K4me3下游效应分子。
该研究首次揭示H3K4me3-RSPO3-Wnt轴在毛囊发育中的核心作用:H3K4me3通过维持RSPO3启动子区开放状态促进其转录,进而增强DPCs分泌Wnt信号的能力,形成正反馈循环。这一发现不仅丰富了毛囊发育的表观遗传理论,更为绒毛生长调控提供了潜在靶点。研究采用的CUT&Tag与单细胞转录组整合策略,为其他器官发育的表观遗传研究提供了范式。