基于SCoT标记的紫花苜蓿(Medicago sativa L.)遗传多样性与群体结构解析及其育种意义

为解析紫花苜蓿(Medicago sativa L.)遗传多样性以指导品种改良，研究人员采用10个SCoT分子标记对85份栽培与野生基因型进行分析。结果显示：92个多态性条带平均PIC值0.34，AMOVA表明74%变异存在于基因型内，STRUCTURE分析鉴定出3个遗传簇（Fst 0.048-0.103），SCoT-2/3引物多态性最佳。该研究为紫花苜蓿种质创新提供了分子依据。

　　

紫花苜蓿(Medicago sativa L.)作为重要牧草，其遗传多样性图谱的绘制对种质创新至关重要。研究团队巧妙运用起始密码子靶向(Start Codon Targeted, SCoT)分子标记技术，对横跨栽培与野生群体的85份材料进行深度扫描。实验数据亮眼：10个SCoT引物共捕获92条清晰条带，其中SCoT-2和SCoT-3这对"黄金搭档"展现出最强的多态性探测能力，平均多态性信息含量(PIC)达到0.34。

分子方差分析(AMOVA)揭开了有趣的遗传分布格局——就像打开一个俄罗斯套娃，74%的遗传变异隐藏在个体基因型内部，而剩余26%的差异则分布在STRUCTURE软件识别的三个亚群之间。这些亚群间的分化程度颇具戏剧性，成对遗传分化指数(F_st)在0.048到0.103区间跳动，暗示着适度但显著的群体分隔。

研究团队通过主坐标分析(PCoA)和UPGMA聚类两把"遗传放大镜"，从不同角度验证了群体结构模式。这些发现不仅证实了SCoT标记在苜蓿遗传研究中的"火眼金睛"特性，更为育种家们提供了精准的分子导航图，为培育兼具高产与抗逆特性的"超级苜蓿"奠定了科学基石。