基于转录组测序的SSR和SNP标记分析揭示葫芦(Lagenaria siceraria)地方品种遗传多样性及其形态差异机制

为解决中国葫芦地方品种形态变异与遗传关系缺乏系统整理的问题，研究人员通过收集33个不同果形品种，结合表型系统分类与转录组测序技术，对比'Central Asian alvo'和'Manus torquent'两个极端果形品种，发现萜类/黄酮生物合成及辅因子代谢通路差异，并开发SSR和SNP标记实现遗传水平分类，为葫芦种质鉴定及分子标记辅助育种提供重要依据。

　　

在中国广泛栽培的葫芦(Lagenaria siceraria)拥有丰富的地方品种资源，其果实形状和大小存在显著差异。然而，这些品种的形态变异与遗传关系长期缺乏系统研究。最新研究通过对33个不同果形地方品种的表型系统分类，选取具有典型差异的'Central Asian alvo'（中亚葫芦）和'Manus torquent'（扭曲葫芦）进行转录组测序(RNA-seq)，发现两者在萜类化合物(terpenoids)和黄酮类(flavonoids)生物合成通路、以及辅因子与维生素代谢途径存在显著差异。基于测序数据开发的简单序列重复(SSR)和单核苷酸多态性(SNP)分子标记，首次在遗传层面建立了葫芦地方品种的系统分类体系，成功解析了形态差异的分子机制。该研究不仅为葫芦种质资源鉴定提供了新型分子标记，其建立的SSR/SNP标记辅助选择体系，更为葫芦品种改良和特色性状定向育种奠定了重要基础。