坛紫菜叶片厚度候选基因的BSA-seq与RNA-seq整合分析及功能验证

为解决坛紫菜(Pyropia haitanensis)叶片厚度这一重要数量性状的遗传机制问题，研究人员通过构建双单倍体(DH)群体，结合混池分离分析测序(BSA-seq)和转录组测序(RNA-seq)技术，鉴定出17个候选基因。其中Ph1g02152(SUF4结构域蛋白)和Ph1g02161(Cupin结构域蛋白)参与细胞壁合成，3个基因(Ph1g02176/Ph1g02177/Ph1g02296)表达量在厚薄品系间差异显著，为分子育种提供了精准靶点。

　　

这项研究揭开了海藻界"颜值担当"坛紫菜的厚度之谜！科研团队巧妙运用双单倍体(DH)群体"基因放大镜"，通过混池分离分析测序(BSA-seq)在1号染色体上锁定7个厚度相关候选区段，包含220个基因"嫌疑人"。转录组测序(RNA-seq)技术则像"基因测谎仪"，发现35日龄叶片的差异表达基因(DEGs)主要活跃在碳代谢和细胞周期"作案现场"。

通过ΔSNP-index=1的"基因指纹"严格筛查，17个关键候选基因浮出水面。其中Ph1g02152和Ph1g02161这对"细胞壁建筑师"分别编码SUF4和Cupin结构域蛋白，而Ph1g02176等3个基因在厚薄品系间的表达差异堪比"基因音量调节器"。最令人振奋的是，9个外显子SNP位点验证成功率高达100%，这些"基因条形码"为坛紫菜分子育种提供了精准导航。

这项研究不仅破解了海藻厚度性状的"遗传密码"，更为培育"肤若凝脂"的高品质坛紫菜品种按下了加速键。未来海苔零食的爽脆口感，或许就藏在这些厚度相关基因的微妙调控之中！