囊性纤维化中心 Mycobacterium abscessus 分离株的基因组与流行病学调查揭示潜在传播途径

为解决囊性纤维化(CF)患者中非结核分枝杆菌(NTM)的潜在传播问题，研究人员通过全基因组测序(WGS)和流行病学调查，分析了Dell儿童医学中心57例CF患者的167株Mycobacterium abscessus分离株，发现4个基因簇，其中1例患者同时感染两种亚型。研究揭示了医疗环境中人际传播的可能性，为CF中心的感染防控提供了重要依据。

　　

在囊性纤维化(CF)患者群体中，非结核分枝杆菌(NTM)感染已成为日益严峻的临床挑战。其中，Mycobacterium abscessus因其耐药性强、治疗困难而备受关注。更令人担忧的是，全球多个CF中心报告了疑似医疗相关NTM暴发事件，但传播途径仍不明确。这种不确定性不仅给临床管理带来困扰，更引发了患者对医疗环境安全性的担忧。

为解开这一谜团，来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校(University of North Carolina at Chapel Hill)的研究团队开展了一项开创性研究。研究人员聚焦Dell儿童医学中心/ Ascension联合CF项目，对2016-2018年间57例CF患者的167株M. abscessus分离株进行了系统分析。这项发表在《Journal of Cystic Fibrosis》上的研究，首次全面评估了该中心NTM感染的传播模式。

研究采用了多项关键技术：全基因组测序(WGS)用于鉴定基因相似的分离株；流行病学调查通过电子健康记录分析患者接触史；环境采样检测医疗场所的灰尘和水生物膜；流域绘图评估家庭环境暴露风险。此外，研究还运用了泛基因组分析评估菌株间遗传相关性。

研究结果部分，基因组分析揭示了4个M. abscessus基因簇，包括2个ssp. abscessus和2个ssp. massiliense簇。值得注意的是，1例患者同时感染了两种亚型的聚类菌株。流行病学调查显示，所有聚类都存在医疗相关传播的机会。特别是一对ssp. massiliense感染患者显示出与同住兄妹对相当的基因组相关性，支持医疗环境中人际传播的可能性。

环境采样方面，从137份医疗环境样本中分离出17株NTM，但患者聚类菌株与医院环境分离株在基因组水平上不匹配。仅1例医院环境分离株与从未接触医院环境的患者呼吸道分离株存在遗传相似性。流域分析未发现聚类患者居住在同一流域的证据。

在讨论部分，研究强调了几个关键发现：首先，确认了一例明确的医疗相关人际传播案例(A4-A5对)，其基因组相似度与同住兄妹相当。其次，发现了罕见的同一患者感染两种亚型聚类菌株的现象，提示可能存在多种环境暴露源。值得注意的是，研究未发现优势流行克隆(DCC)与毒力增强的直接关联。

这项研究的意义在于：建立了医疗环境中NTM传播的评估框架；证实了CF中心人际传播的可能性；为感染防控提供了基因组流行病学依据。特别是开发的"医疗相关传播调查工具包"(HALT NTM toolkit)，为未来类似调查提供了标准化方案。研究结果提示，加强环境监测和感染控制措施对预防NTM传播至关重要，同时也呼吁开展更大规模的前瞻性研究以进一步阐明传播机制。