环塞内加林A类似物的结构设计与合成

《Journal of Heterocyclic Chemistry》：Structural Design and Synthesis of Cyclosenegalin A Analogue

本研究利用计算工具PEP-FOLD4、iAMPpred和AI4AMP设计并合成了环状新segmentsin A类似物c-AVKPGLK，解决了原化合物合成产率低、无抗菌活性的问题。通过固相-液相联合合成策略，线性前体产率达97.76%，环化步骤产率23.38%，最终产物经多种光谱技术表征，展现出显著的抗菌活性，结构紧凑利于cyclization。

　　

安德森·阿诺德·阿洛尼斯（Anderson Arnold Aloanis）|塔蒂·赫琳娜（Tati Herlina）|阿里·哈迪安托（Ari Hardianto）|拉尼·玛哈拉尼（Rani Maharani）

印度尼西亚马纳多国立大学（Universitas Negeri Manado）化学系，马纳多

摘要

计算方法在肽合成中的应用日益广泛。在本研究中，我们报道了一种环塞内加林A（cyclosenegalin A）类似物的计算机辅助设计与合成。最初的环塞内加林A合成产率较低，且不具备抗菌活性。为了解决这些问题，我们使用了PEP-FOLD4、iAMPpred和AI4AMP等计算工具来设计该类似物，旨在促进环化反应并增强其抗菌性能。通过对环塞内加林A及其类似物的计算分析，发现c-AVKPGLK是最有开发潜力的候选化合物。该化合物表现出较强的抗菌潜力，具有最高的抗菌和抗真菌活性，并且其结构紧凑，有利于环化反应的进行。c-AVKPGLK的线性前体能够形成稳定的β-转角结构，非常适合合成。合成过程结合了固相和液相肽合成技术：线性前体采用Fmoc策略制备，使用HATU作为偶联剂和2-氯三苯甲基氯树脂；环化反应在稀释条件下通过滴加法进行，同样使用HATU作为偶联剂。线性前体的产率为97.76%，而环化产率为23.38%。最终化合物c-AVKPGLK通过HR-ToFMS、¹H NMR、¹³C NMR、HMQC、HMBC、TOCSY和ROESY等技术进行了结构表征。