高灵敏度液体活检技术Northstar Select?的临床验证:突破低丰度ctDNA检测瓶颈的全面基因组分析新方法

【字体: 时间:2025年08月09日 来源:The Journal of Liquid Biopsy

编辑推荐:

  本研究针对当前液体活检在低变异等位基因频率(VAF<0.5%)和拷贝数变异(CNV)检测中的灵敏度不足问题,开发了基于QCT?技术的Northstar Select?全面基因组分析(CGP)检测方法。通过674例回顾性分析和182例前瞻性头对头研究证实,该检测对SNV/Indel的检测限(LOD95)低至0.15% VAF,CNV检测灵敏度提升109%,可减少45%的无效报告,为低脱落肿瘤患者的精准诊疗提供新工具。

  

在精准肿瘤学快速发展的今天,组织活检的局限性日益凸显——26%的实体瘤样本因质量或数量不足无法满足检测需求,且存在操作风险和高时空异质性。尽管液体活检凭借其非侵入性和全景捕获优势被纳入NSCLC等4种癌症的临床指南,但现有检测对VAF<0.5%的变异和CNV识别能力不足,导致25%的NSCLC驱动突变和多数低脱落肿瘤变异被漏检。

BillionToOne, Inc.(美国门洛帕克)的研究团队开发了新一代液体活检检测Northstar Select?。这项覆盖84个基因的"肿瘤组织非依赖性"CGP检测,通过创新的定量计数模板(QCT)技术和生物信息学算法优化,在《The Journal of Liquid Biopsy》上报告了其突破性性能。研究采用674例回顾性临床样本建立基线特征,并通过182例前瞻性头对头试验对比5种市售检测。关键技术包括:1)基于QCT的cfDNA提取和目标富集技术;2)可区分局灶性事件与染色体非整倍体的CNV算法;3)96个微卫星位点的MSI分析体系;4)通过匹配外周血gDNA排除克隆性造血干扰。

【Northstar Select Assay and Analytical Validation】

验证显示该检测对SNV/Indel的LOD95达0.15% VAF(经ddPCR确认),CNV检测灵敏度达2.11拷贝(扩增)和1.8拷贝(缺失),融合基因和MSI-H的检测限分别为0.3%和0.07%肿瘤分数。

【Head-to-Head Comparison to On-Market Assays】

在182例多癌种前瞻性研究中,Northstar Select比对照检测多识别51%的致病性SNV/Indel和109%的CNV,使无效报告减少45%。91%的新检出临床可操作变异位于VAF<0.5%区间,包括17%更多具有FDA批准疗法的Tier 1A变异(如KRAS G12D等)。

【Clinical Utility of Enhanced Sensitivity】

674例真实世界数据分析显示,24%患者属于低脱落型(中位VAF<0.5%),其中前列腺癌达40%。该检测在CNS肿瘤中仍保持30%临床可操作变异检出率,显著高于文献报告的27-55%。

【Validation of Enhanced Sensitivity】

ddPCR验证证实98%的检测一致性(Lin's相关系数0.965)。通过45例配对cfDNA-buffy coat分析证实,新增检出并非源于克隆性造血(CHIP),其KRAS G12D等驱动突变均为肿瘤源性。

该研究确立了液体活检的新灵敏度标杆,其技术突破主要体现在三方面:首先,0.15% VAF的检测限可捕捉传统方法遗漏的低丰度变异;其次,创新的CNV算法能区分致癌性局灶变异与治疗抗性相关的非整倍体;最后,多维度质控体系确保检测特异性。这些进展使得ESR1突变等低VAF变异指导的激素治疗、PTEN缺失提示的PI3K/AKT1抑制剂应用等精准决策成为可能,尤其惠及无法获取组织样本或低脱落肿瘤患者。随着Elacestrant等基于液体活检的伴随诊断获批,这项技术将加速"血浆优先"诊疗模式的临床转化。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号