
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
基于多重PCR与斑点印迹法的比较研究:孟加拉国腹泻患者ETEC定植因子检测新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月09日 来源:Journal of Microbiological Methods 1.9
编辑推荐:
为解决传统斑点印迹法(dot blot)单克隆抗体受限问题,孟加拉国国际腹泻病研究中心(icddr,b)团队首次采用多重PCR技术对531例ETEC感染患者的定植因子(CFs)进行检测,发现CFA/I+CS21等组合为优势型别,验证了PCR法较dot blot检出率提升11%且更高效,为ETEC监测提供新技术方案。
在发展中国家,由产肠毒素大肠杆菌(Enterotoxigenic Escherichia coli, ETEC)引发的腹泻仍是重大公共卫生问题。这种病原体通过表面特殊的定植因子(Colonization Factors, CFs)黏附于小肠上皮,而准确识别CFs对疫苗研发和流行病学监测至关重要。传统检测依赖基于单克隆抗体的斑点印迹法(dot blot),但抗体试剂的短缺严重制约了研究进展。
针对这一技术瓶颈,孟加拉国国际腹泻病研究中心(International Centre for Diarrhoeal Disease Research Bangladesh, icddr,b)的Md. Ariful Amin团队开展了一项创新性研究。通过对2023-2024年5914例腹泻患者的监测,研究人员首次建立多重PCR检测体系,系统评估了ETEC菌株的CFs分布特征,并与传统dot blot方法进行头对头比较。该成果发表于《Journal of Microbiological Methods》,为资源有限地区的ETEC监测提供了更优解决方案。
研究采用三大关键技术:1)基于热不稳定毒素(LT)和热稳定毒素(ST)基因的PCR初筛从531例ETEC感染者获取菌株;2)建立包含CFA/I、CS1-CS7及CS21等靶标的多重PCR检测体系;3)用157株菌株平行比较PCR与dot blot的检测效能。结果显示:
毒素型别分布
通过LT/ST-PCR分型发现,ST单一毒素型占比最高(40%),LT+ST混合型(38%)次之,单一LT型仅22%,反映ST可能为当地优势毒力因子。
CFs流行特征
新型多重PCR检出率达51%,显著识别出四大流行CFs组合:CFA/I+CS21、CS6±CS21、CS5+CS6及CS1+CS3+CS21。值得注意的是,CS21作为辅助定植因子,在CFA/I或CS6阳性株中PCR法较dot blot多检出11%,揭示传统方法可能低估其流行率。
方法学验证
157株平行检测显示两种方法高度一致(Kappa值>0.85),但PCR在操作时长(4小时vs 2天)、成本及通量方面优势显著,特别适合大规模筛查。
该研究首次证实多重PCR可作为dot blot的替代方案,其高敏感性尤其适合CS21等易被忽视的CFs检测。对于正在开展ETEC疫苗临床试验的孟加拉国而言,精准的CFs流行病学数据将直接指导疫苗组分选择。更重要的是,该方法突破抗体依赖的技术壁垒,为其他发展中国家建立自主监测体系提供范本。未来研究可进一步优化引物组合,纳入新发现的CFs靶点以保持技术前瞻性。
生物通微信公众号
知名企业招聘