新型ddPCR技术检测BRCA1和RAD51C甲基化：推动卵巢癌HRD检测的突破性进展

【编辑推荐】本研究开发了基于微滴式数字PCR（ddPCR）的BRCA1/RAD51C启动子甲基化检测新技术，在224例卵巢癌（OC）队列中验证显示：41.6%患者存在BRCA1甲基化，36.3%的基因组不稳定性指数（GII）阳性病例通过甲基化分析明确了同源重组缺陷（HRD）状态，为PARP抑制剂（PARPi）精准治疗提供了重要分子标志物。

【Highlight】

这项开创性研究揭示了启动子甲基化在HRD机制中的关键作用，通过创新性ddPCR技术实现了BRCA1/RAD51C甲基化的精准定量，为卵巢癌精准治疗开辟了新路径。

【ddPCR检测性能】

甲基化梯度稀释实验构建的线性回归模型显示R²=0.9983，变异系数(CV)仅8.83%，证明该方法具有卓越的准确性和可重复性。酶转化法相比传统亚硫酸氢盐转化，显著减少了DNA降解（约50%片段损失），使FFPE样本检测成功率提升至92.3%。

【讨论】

现有HRD检测存在"灰色地带"：39.7%患者虽呈现基因组不稳定性（GII>0），但仅31.2%携带BRCA1/2突变。我们的ddPCR技术成功鉴定出41.6%病例存在BRCA1启动子甲基化，使36.4%的GII阳性患者获得明确HRD分类。特别值得注意的是，1例RAD51C甲基化病例的发现，印证了表观遗传调控在HRR通路中的广泛影响。

【结论】

本研究建立的ddPCR甲基化检测体系如同"分子探针"，精准捕捉BRCA1/RAD51C表观遗传沉默特征。在32例BRCA1甲基化患者中，甲基化水平与HRD表型高度吻合（p<0.001），为PARPi治疗筛选提供了"甲基化指纹"新标准。这项技术突破将推动HRD检测进入"多组学整合"时代。