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综述:G蛋白偶联受体构象对信号偏置的影响:整合模拟与生物物理实验
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月09日 来源:Pharmacology & Therapeutics 12.5
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这篇综述深入探讨了G蛋白偶联受体(GPCR)构象动态如何通过整合计算模拟与生物物理实验技术(如NMR、DEER、smFRET)驱动信号偏置(signaling bias),重点解析了μOR、AT1R等靶点的结构机制与药物设计策略,为开发精准靶向GPCR的偏向性配体(如TRV027、Oliceridine)提供理论框架。
G蛋白偶联受体(GPCR)作为最大的膜蛋白家族,通过G蛋白(如Gs/Gi)和β-抑制蛋白(β-arrestin)等多条通路转导信号。偏向性配体(如β2AR激动剂carvedilol)可选择性激活特定路径,其机制与受体构象微调密切相关。例如,β-arrestin偏向性配体通过稳定TM7的NPxxY基序构象,促进EGFR反式激活,从而发挥抗纤维化作用。
冷冻电镜结构揭示,TM6外移程度决定效应器选择性:Gs偶联需较大位移,而Gi/β-arrestin偶联时位移较小。保守的微开关(如CWxP6.50、DRY3.50)构象变化是偏置信号传递的关键。19F NMR显示,β-arrestin偏向配体carvedilol通过改变TM7化学位移,诱导独特的活性态构象。
血管紧张素受体AT1R的肽类配体TRV027因F8残基缺失,仅浅层嵌入结合口袋,导致Gq信号减弱而偏向β-arrestin通路。分子动力学(MD)模拟发现,L1123.36旋转会阻碍钠离子结合位点重构,该机制被用于设计β-arrestin偏向性更强的Ind8-AngII。μOR镇痛药Oliceridine则通过减少与TM6/TM7的接触,降低β-arrestin募集,验证了"TM3侧结合促G蛋白信号"的药效团模型。
5-HT2BR配体ergotamine通过萘甲酰亚胺基团占据ECL2变构位点,实现β-arrestin偏向激活。CB1R变构调节剂ZCZ011结合TM2-TM4界面,稳定Gi偶联构象,而钠离子口袋靶向的μOR配体C6-guano则完全规避β-arrestin通路。值得注意的是,5-HT2AR配体IHCH-7086通过结合延伸口袋(EBP)和部分占据正构位点,实现无致幻作用的抗抑郁效果。
13C/19F NMR通过标记M2455.49等残基,成功区分μOR配体的偏向特性。DEER光谱显示AT1R的β-arrestin偏向态具有更狭窄的胞内裂隙。单分子荧光(smFRET)则捕捉到CXCR4与ACKR3激活速率的差异,后者因快速构象转换呈现更高基础活性。氢氘交换质谱(HDX-MS)进一步证实ICL2/ICL3的柔性变化是G蛋白偶联的分子标志。
增强采样算法如元动力学(MetaD)发现,A2AR存在伪活性态(pAs),其R2055.66-E2286.30盐桥可同时兼容Gs和β-arrestin结合。自适应偏置MD显示,μOR配体fentanyl的N-烷基链长度直接影响M1353.36接触强度,进而调控β-arrestin偏向性。粗粒化模拟则揭示胆固醇通过结合CRB1的W2414.50位点,调控受体二聚化过程。
尽管TRV027在心力衰竭临床试验中未达预期,但整合多尺度研究方法(如时间分辨冷冻电镜与深度学习辅助的MD)将持续推动GPCR偏向性药物的理性设计。未来需解决钠离子变构调节、脂质微环境作用等未解问题,并建立更精准的偏置量化模型。
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