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优化合成mRNA的UTR序列与异源poly(A)尾设计:提升翻译效率与稳定性的机制研究及疫苗应用验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月09日 来源:Molecular Therapy Nucleic Acids 6.1
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本研究针对合成mRNA技术中UTR序列和poly(A)尾的优化难题,系统评估了6种5'UTR、9种UTR组合及新型A/G混合尾在体外和体内的表现。研究人员发现人α-珠蛋白5'UTR(hAg)与VP6/SOD 3'UTR组合显著提升翻译效率,开发的A/G尾在细菌模板稳定性上优于传统A30L70尾。通过SRCD结构分析、多核糖体图谱等技术,揭示了UTR结构与翻译效率的关联,并在SARS-CoV-2 Spike mRNA疫苗模型中验证了其应用潜力,为mRNA药物设计提供了新策略。
在生物医药领域,mRNA技术因其快速响应和灵活设计的特性成为革命性平台,但翻译效率和稳定性仍是制约其疗效的关键瓶颈。传统poly(A)尾在质粒扩增时易截短,而UTR序列的优化缺乏系统性指导原则。这些问题直接影响mRNA药物的蛋白产量和持久性,成为制约临床转化的"卡脖子"难题。
法国国家科学研究中心分子生物物理中心(Centre de Biophysique Moléculaire CNRS UPR4301)的Ayoub Medjmedj团队在《Molecular Therapy Nucleic Acids》发表的研究中,以辉瑞-BioNTech COVID-19疫苗序列为参照,通过多维度评估体系揭示了mRNA元件优化的黄金法则。研究采用SRCD解析二级结构、多核糖体图谱分析翻译动态、FISH-Flow单细胞mRNA追踪等技术,结合LNP递送系统,在细胞模型和小鼠体内验证了优化序列的效能。
Alternative poly(A) tail
团队设计的A/G混合尾(12个AAAAAAAAAAG重复单元)在细菌质粒中保持100%完整性,显著优于传统A120尾(仅10%完整)。SRCD显示其熔解温度(Tm=69.8°C)与A30L70尾(76.6°C)相当。在HeLa细胞中,A/G尾初期翻译效率与A30L70相当,后期略低15%,但小鼠肌肉注射显示二者体内表达量差异不足10%。
5′ UTR selection
7种5'UTR的横向比较揭示:人α-珠蛋白(hAg)、合成UTR3/UTR4等帽依赖性UTR的翻译效率远超VCIP/EMCV/CrPV等IRES序列(<20%)。值得注意的是,热休克蛋白Hsp70 5'UTR在树突细胞(DC2.4)中表现优异,可能与其双重翻译启动机制相关。
Evaluation of 5′ and 3′UTR combinations
hAg 5'UTR与VP6/SOD 3'UTR组合在AB1079肌细胞中使Spike蛋白产量提升40%。多核糖体分析显示hAg-VP6 mRNA的核糖体负载量最高,而UTR4-SOD组合在MoDC中翻译效率降低50%,SRCD证实UTR4的Tm最低(59.6°C),提示结构不稳定性。
Half-life and polysome profiling
FISH-Flow证实不同UTR组合的mRNA半衰期相似,但核糖体结合率差异显著:hAg-VP6 mRNA的核糖体结合率是UTR3-SOD的4倍,印证了翻译效率差异主要源于核糖体招募能力而非稳定性。
Evaluation of therapeutic potential
在SARS-CoV-2疫苗接种模型中,hAg-VP6 mRNA诱导的IgG抗体滴度较基准提高30%,但加强免疫后所有组别中和抗体水平趋同。值得注意的是,A/G尾疫苗组显示更强的抗体反应趋势,为后续优化指明方向。
这项研究建立了mRNA元件"序列-结构-功能"的定量关系,首次证实:①A/G混合尾可解决质粒不稳定性难题;②VP6/SOD 3'UTR能突破现有疫苗的蛋白产量瓶颈;③UTR的翻译效率取决于核糖体负载能力而非稳定性。这些发现为肿瘤疫苗、蛋白替代疗法等mRNA应用场景提供了标准化设计框架,尤其对需要长期表达的遗传病治疗具有重要启示。研究揭示的UTR组合特异性效应(如UTR4在MoDC中的低效性)警示临床前需进行多模型验证,避免"优质序列"的适用性误判。
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