基于基因组浅层测序数据的党参属(Codonopsis)物种鉴定研究：超级条形码技术破解近缘种分类难题

来自沈阳师范大学、中国科学院昆明植物研究所、浙江大学和沈阳大学的研究团队针对党参属(Codonopsis)这一形态相似度高、表型可塑性强的药用植物分类难题，通过分析36种81个样本的质体基因组(plastome)、核核糖体DNA(nrDNA)和线粒体编码序列(CDS)，证实超级条形码(super-barcodes)较传统条形码显著提升物种分辨力，意外发现高变异的线粒体DNA鉴别效力堪比质体CDS组合，为快速辐射进化类群的物种界定提供了新思路。

　　

这项突破性研究揭示了基因组浅层测序(genome skimming)技术在解决药用植物分类学困境中的巨大潜力。面对党参属(Campanulaceae)42个亚洲物种间惊人的形态相似性和环境适应性表型变异，科研团队系统评估了传统DNA条形码与超级条形码的鉴别效能。

研究团队构建了涵盖36个物种81个个体的党参属DNA条形码库，发现质体基因组(plastome)和核核糖体DNA(nrDNA)组成的超级条形码展现出远超常规条形码的系统发育解析力。令人惊讶的是，通常被认为变异率低的植物线粒体蛋白编码序列(CDS)竟表现出与质体CDS组合相当的物种区分能力，这一反传统认知的发现为植物系统学研究开辟了新视角。

然而，研究也指出器官elle基因组无法完全界定党参属物种边界，这可能与该类群的快速进化辐射、不完全谱系分选(ILS)、自然杂交和强选择压力等复杂进化历史有关。这些发现不仅为生物多样性热点地区的近缘种鉴定提供了新范式，更提示未来需要开发多位点核标记来进一步提升鉴别效力。

科研团队特别强调，这项研究建立的跨国合作模式实现了遗传样本与学术资源的优势互补，所有数据均通过公共数据库共享，充分体现了生物多样性研究的惠益共享原则。