新型RXR激动剂支架的发现:显著偏向同源二聚体激活的选择性调控

【字体: 时间:2025年08月10日 来源:Journal of Medicinal Chemistry 6.8

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  为解决RXR(维甲酸X受体)激动剂在多种二聚体形式中活性混杂的问题,德国慕尼黑大学的研究团队开发了一种新型RXR配体化学型。该支架能选择性激活RXR同源二聚体(homodimer)并显著抑制异源二聚体(heterodimer)活性,其纳米级效价与结构机制为靶向核受体信号通路提供了新工具,相关成果发表于《Journal of Medicinal Chemistry》。

  

在核受体信号传导的复杂网络中,维甲酸X受体(Retinoid X Receptor, RXR)如同一个"分子变色龙",能与多种配体激活的转录因子形成异源二聚体(heterodimer),参与调控从代谢平衡到神经元存活等生理过程。这种多面性虽然赋予了RXR治疗癌症、炎症、代谢综合征和神经退行性疾病的潜力,却也导致现有激动剂如贝沙罗汀(bexarotene)产生难以预测的脱靶效应。当RXR与PPARγ(过氧化物酶体增殖物激活受体γ)等伙伴形成异源二聚体时,可能引发甘油三酯升高、甲状腺功能异常等副作用,这成为开发精准靶向药物的关键瓶颈。

针对这一挑战,德国慕尼黑大学(Ludwig-Maximilians-Universit?t München)药学院的Felix Nawa、Daniel Merk等研究者展开了一项突破性研究。他们通过结构导向的药物设计,发现了一种全新RXR配体化学型,该支架能像"分子剪刀"般精确区分RXR的同源二聚体(homodimer)与异源二聚体激活途径。研究显示,优化后的化合物对RXR同源二聚体的激活效力达到纳摩尔级别,而对RXR-PPARγ等异源二聚体的激活活性则较贝沙罗汀显著降低。更令人振奋的是,共晶结构分析揭示该配体通过诱导RXR配体结合域(LBD)的特异性构象变化,形成与经典激动剂截然不同的"分子指纹",这为理解RXR信号的选择性调控提供了结构基础。

研究团队主要运用了三种关键技术:基于结构的虚拟筛选从化合物库中初筛候选分子;表面等离子共振(SPR)检测配体与RXR的结合动力学;X射线晶体学解析配体-RXR LBD复合物三维结构(分辨率达2.1?)。这些方法相互印证,构建了从分子识别到功能调控的完整证据链。

在"Scaffold Identification and Optimization"部分,研究者通过系统构效关系研究,将先导化合物的RXR激活效力提升300倍,同时保持对PPARγ/RXR异源二聚体的低活性。晶体结构显示,该支架的联苯基团与RXR LBD的H5螺旋形成独特相互作用,这与贝沙罗汀诱导的H12螺旋位移机制形成鲜明对比。

"Dimer-Selective Activation Profiling"实验证实,新化合物在报告基因检测中呈现显著的同源二聚体偏好性——当RXR以同源二聚体形式存在时,其EC50为87nM,而对RXR-LXR(肝X受体)异源二聚体的激活需要超过10μM浓度。这种超过100倍的选择性窗口远超现有临床药物。

"Structural Basis of Selectivity"部分通过比较结构生物学揭示,新配体诱导的RXR LBD构象变化主要发生在β-sheet区域,导致共激活因子结合界面发生微调。这种"局部重塑"模式不同于传统激动剂的全局构象变化,可能解释其对不同二聚体组合的差异化调控能力。

这项研究不仅提供了首个具有显著同源二聚体选择性的RXR化学型,更开创性地证明:RXR的不同分子活性可以通过配体结构精确"分频"。这种策略为开发更安全的核受体靶向药物指明方向——未来或可设计分别靶向RXR同源二聚体、RXR-PPARγ、RXR-LXR等特定复合物的"精准激动剂",从而规避现有药物的系统性副作用。论文中揭示的"局部构象调控"机制,对理解其他核受体的选择性激活也具有普适意义。正如研究者强调,这项工作"为探索RXR同源二聚体在生理病理中的独特功能提供了首个分子工具",其价值将随着后续生物学研究的展开而持续显现。

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