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血清与血浆中microRNA的稳定性分析:循环生物标志物的可靠性与临床应用潜力
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月10日 来源:Non-coding RNA Research 4.7
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本研究针对循环microRNA(miRNA)作为疾病诊断标志物的稳定性问题,通过模拟临床样本处理延迟场景,系统评估了血清/血浆中miRNA在0-24小时内的稳定性。研究人员采用RT-qPCR和小RNA测序技术,证实miR-15b/16/21/24/223等关键miRNA及整体miRNA组在室温下保持99%稳定性,为基于miRNA的无创诊断技术开发奠定了方法学基础。
在疾病早期诊断领域,血液检测因其无创性始终是研究热点。然而传统RNA生物标志物面临严峻挑战——无处不在的核糖核酸酶(RNase)会导致长链mRNA迅速降解。相比之下,长度仅21-25个核苷酸的microRNA(miRNA)因其特殊的稳定性机制(如外泌体包裹或与蛋白质结合)展现出独特优势。这类小分子非编码RNA(ncRNA)不仅数量庞大(人体内预测超过5000种),还具有组织特异性和疾病相关性,在癌症、心血管疾病、神经系统疾病等领域显示出巨大诊断潜力。但关键问题悬而未决:这些"分子指纹"能否经受住临床采血、运输和处理过程中的现实考验?
美国凯斯西储大学(Case Western Reserve University)Case综合癌症中心的研究团队在《Non-coding RNA Research》发表的重要研究,首次系统评估了miRNA在血清和血浆中的稳定性特征。研究人员通过设计时间梯度实验(0-24小时)模拟临床延迟处理场景,结合RT-qPCR靶向检测和高通量small RNA-seq技术,对5名健康志愿者的样本进行多维度分析。关键技术包括:从全血分离血浆/血清后设置不同处理延迟时间窗;采用miRNeasy试剂盒提取miRNA;使用TaqMan探针进行特异性miRNA定量;通过Illumina HiSeq平台开展small RNA测序;应用miRDeep2和DESeq2进行生物信息学分析。
Calibration of miRNA and degradation of mRNA over time
研究首先建立技术标准:miR-16的连续稀释实验显示RT-qPCR检测线性良好(斜率1.397),而对照实验证实长链mRNA(β-Actin和18S)在室温下6小时即出现显著降解,为后续miRNA稳定性研究提供参照基准。
Targeted miRNA analyses of blood samples stored on ice
冰浴保存条件下,血清中5种典型miRNA(miR-15b/16/21/24/223)的Cq值(定量周期)在24小时内波动小于5%,证明低温处理可完全保持miRNA完整性。
Targeted miRNA analyses of blood samples stored at room temperature
更令人惊讶的是,室温储存组同样表现出卓越稳定性——所有靶向miRNA的Cq值变异系数低于3%,打破了对RNA常温不稳定的传统认知。
miRNAome sequencing analysis
小RNA测序揭示更宏观的稳定性证据:在检测到的约650种miRNA中,99%以上在6小时内保持稳定,即使延长至24小时也仅有1-2%的miRNA(主要是低丰度分子)出现统计学差异。值得注意的是,变化miRNA无个体间一致性,暗示检测噪声而非真实降解。
这项研究为循环miRNA的生物标志物应用扫清了关键障碍。首先,其证实miRNA可耐受临床常见的样本处理延迟(如运输或批量处理),这对多中心研究和大规模筛查至关重要。其次,全miRNA组的稳定性验证为基于"分子特征谱"的诊断策略铺平道路——相较于单一miRNA,组合标志物可显著提高诊断特异性。讨论部分特别指出,miRNA的稳定特性可能源于其与外泌体或Argonaute蛋白的结合状态,这种天然"分子盔甲"使其比游离mRNA更适合临床检测。研究者建议未来探索三个方向:扩大疾病特异性miRNA谱验证、优化标准化提取流程、开发整合miRNA与其他组学(如甲基化DNA)的多模态诊断模型。该成果不仅为液体活检领域注入新活力,更重新定义了人们对循环RNA稳定性的认知边界。
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