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姜黄素在肝癌治疗中的分子靶点与作用机制:生物信息学与计算机辅助研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月10日 来源:In Silico Research in Biomedicine
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肝癌是全球癌症相关死亡的主要原因之一,但现有治疗手段对晚期肝细胞癌(HCC/LIHC)效果有限。为解决这一难题,研究人员通过生物信息学分析和计算机辅助技术,探索了天然活性成分姜黄素的治疗潜力。研究发现,姜黄素通过靶向AKT1、GSK3B、MMP9和SERPINE1等关键基因,调控PI3K/AKT、IL-17等信号通路,显著影响LIHC患者的预后。分子对接实验进一步证实了姜黄素与靶蛋白的高亲和力结合。该研究为肝癌治疗提供了新的潜在靶点和药物开发策略,具有重要的临床转化价值。
肝癌是全球癌症相关死亡的第二大原因,其中肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma, HCC/LIHC)占原发性肝癌的75%-85%。尽管近年来诊断和治疗技术有所进步,但晚期LIHC患者的5年生存率仍低于20%,中国患者的生存率甚至不足7%。更严峻的是,目前对晚期LIHC缺乏有效的治疗手段。面对这一重大临床挑战,寻找新的治疗靶点和开发高效低毒的抗癌药物成为当务之急。
密苏里大学Christopher S. Bond生命科学中心的研究团队另辟蹊径,将目光投向了天然活性化合物——姜黄素(Curcumin)。这种从姜黄中提取的多酚类物质已被证明具有广泛的药理活性,包括抗炎、抗氧化和抗肿瘤作用。然而,其在LIHC治疗中的具体分子靶点和作用机制尚不明确。为此,研究人员采用生物信息学分析和计算机辅助技术,系统研究了姜黄素在LIHC治疗中的潜在作用机制,相关成果发表在《In Silico Research in Biomedicine》上。
研究人员主要运用了以下关键技术方法:通过SwissTargetPrediction预测姜黄素的分子靶点;利用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络(PPI);采用Cytoscape筛选关键枢纽基因;通过TCGA和CPTAC数据库分析基因表达与临床预后的相关性;运用CB-DOCK和AutoDock Vina进行分子对接分析。研究队列包括TCGA数据库中的371例LIHC肿瘤样本和50例正常样本。
研究结果主要包括:
药物靶点预测和蛋白质相互作用网络构建
通过SwissTargetPrediction预测获得100个姜黄素潜在靶点,其中20%为氧化还原酶。PPI网络分析显示这些靶点之间存在显著相互作用(p<1.0e-16)。
功能富集和信号通路分析
GO分析显示靶基因主要富集于蛋白加工、β-淀粉样蛋白形成等生物过程;KEGG分析发现这些基因参与PI3K/AKT、PD-L1/PD-1等重要通路。
枢纽基因鉴定
筛选出10个关键枢纽基因,包括AKT1、STAT3、TNF等,这些基因在功能网络中具有最高连接度。
枢纽基因的mRNA表达水平及其与LIHC患者临床结局的关系
TCGA数据分析显示,AKT1、GSK3B、MMP9和SERPINE1在肿瘤与正常组织中的表达差异显著,且与患者生存率显著相关。
关键基因的蛋白质组学表达水平
CPTAC数据显示,AKT1和MMP9在肿瘤中表达降低,而GSK3B和SERPINE1表达升高。
姜黄素与目的基因的分子对接
分子对接显示姜黄素与AKT1(-8.2 kcal/mol)、GSK3B(-7.6 kcal/mol)、MMP9(-9.1 kcal/mol)和SERPINE1(-7.1 kcal/mol)具有较强结合力,氢键和疏水相互作用分析揭示了具体的结合位点。
这项研究的重要意义在于:首次系统鉴定了姜黄素在LIHC治疗中的4个关键靶点(AKT1、GSK3B、MMP9和SERPINE1),并阐明了其通过调控PI3K/AKT等信号通路发挥抗LIHC作用的分子机制。特别值得注意的是,SERPINE1作为新发现的潜在靶点,与肿瘤微环境重塑和免疫浸润密切相关,为LIHC治疗提供了新思路。研究采用的生物信息学与计算机辅助药物设计相结合的策略,不仅加速了药物靶点发现进程,也为其他天然产物的药物开发提供了方法学参考。
当然,研究也存在一定局限性,如缺乏体外和体内实验验证。未来研究需要进一步评估姜黄素的毒副作用,并探索其与其他药物联合使用的协同治疗效果。尽管如此,这项研究为开发基于姜黄素的LIHC治疗策略奠定了重要理论基础,具有广阔的临床转化前景。
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