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缺氧条件下褐腐真菌松生拟层孔菌(Fomitopsis pinicola)降解木材的分子机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月10日 来源:Nature Communications 15.7
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本研究首次揭示褐腐真菌Fomitopsis pinicola在完全缺氧条件下仍能通过分泌植物细胞壁降解酶(PCWDEs)分解木质纤维素。通过野外采样结合固态核磁共振(ssNMR)和蛋白质组学技术,研究人员发现该真菌在缺氧环境中从依赖Fenton反应转向水解酶主导的降解策略,为理解森林碳循环及开发厌氧生物处理技术提供了新视角。
在森林生态系统中,木质纤维素的分解是碳循环的关键环节,而担子菌门真菌是这一过程的主要驱动力。传统研究认为,褐腐真菌依赖需氧的Fenton化学反应降解木材,但木材内部常存在缺氧环境,这种矛盾现象长期未被阐明。最新发表在《Nature Communications》的研究颠覆了传统认知,揭示了褐腐真菌在完全缺氧条件下的生存策略。
法国国家农业食品与环境研究院(INRAE)等机构的研究团队通过多学科方法,首次证实松生拟层孔菌(Fomitopsis pinicola)能在无氧环境中生长并降解木材。研究人员结合野外采样、非侵入式氧浓度监测、定量蛋白质组学和13C标记的固态核磁共振技术,发现该真菌在缺氧条件下会激活一套完整的碳水化合物活性酶(CAZymes)系统,包括内切木聚糖酶(GH10)、阿拉伯呋喃糖苷酶(GH43)和半乳糖苷酶(GH27)等,从而实现对葡甘露聚糖和木聚糖的高效水解。
关键技术包括:1)野外采样建立不同腐烂年限的挪威云杉样本库;2)非侵入式光学传感器监测木材内部O2梯度;3)定量PCR和扫描电镜验证缺氧条件下的菌丝生长;4)基于质谱的蛋白质组学分析分泌酶谱;5)13C固态核磁共振追踪多糖代谢流向。
主要研究结果
A restricted microbial community decomposes wood under O2 constraints in nature
通过野外采样和元蛋白质组学分析,发现木材内部缺氧区域(O2<2%)仍存在活跃的微生物群落,其中F. pinicola在树干中心缺氧区域占主导地位。
Fomitopsis pinicola can grow and decay wood in anoxia
设计特殊培养系统证实该真菌在完全缺氧(O2<2 ppm)条件下仍能生长,14天内造成8-9%的木材质量损失,并通过PACE技术检测到半纤维素骨架的可及性增加。
In anoxia, Fomitopsis pinicola decays wood polysaccharides to build its cell wall
固态核磁共振显示,缺氧培养的木材中乙酰化甘露聚糖信号(101 ppm)显著降低,同时检测到真菌细胞壁组分β-1,3-葡聚糖(87.0/68.3 ppm)和几丁质(55.4/103.9 ppm)的合成信号。
Secretion of a complete set of PCWDEs in anoxia
蛋白质组学揭示缺氧条件下GH10、GH43等水解酶表达量增加25%,而需氧的草酸氧化酶(产生H2O2)仅在常氧条件下检测到,表明代谢策略的彻底转变。
这项研究改写了传统木质纤维素降解理论,提出褐腐真菌采用"阶梯式"降解策略:在富氧表层依赖Fenton反应,而在缺氧深层转为酶水解主导。该发现不仅解释了真菌在自然界的广泛分布,还为开发新型厌氧生物炼制技术提供了酶资源。研究强调,现存真菌基因组中保留的水解酶基因库具有重要的生态适应意义,这种缺氧代谢能力可能在担子菌中比预想的更为普遍。



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