苯甲醇类1'-乙酰氧基胡椒酚乙酸酯类似物作为金黄色葡萄球菌sdrE黏附蛋白抑制剂的探索：抗菌活性与多计算分析

这篇研究探索了基于1'-乙酰氧基胡椒酚乙酸酯(ACA)的苯甲醇类似物(3b、3e、3f)作为金黄色葡萄球菌(S. aureus)黏附蛋白sdrE抑制剂的潜力。通过体外实验和计算生物学方法(分子对接、分子动力学模拟、PLIP分析、PCA、FEL和DFT计算)，发现3e能中度抑制S. aureus生长，并通过与sdrE关键残基结合(-12 kcal/mol结合能)干扰补体调节因子H(fH)的结合，为开发新型抗S. aureus感染药物提供了理论依据。

　　

Highlight

本研究初步探索了苯甲醇类似物（特别是化合物3e）作为金黄色葡萄球菌(S. aureus)黏附蛋白sdrE抑制剂的抗菌潜力。体外琼脂扩散实验显示，3e对S. aureus具有显著抗菌活性，其抑制效果优于其他测试配体。分子对接分析将sdrE确定为主要作用靶点，3e展现出最强的结合能力。

The Kirby Bauer method

Kirby-Bauer法是微生物学中评估抗生素效力的经典方法。本研究中，将金黄色葡萄球菌(ATCC 25923)均匀涂布于琼脂平板，放置含环丙沙星(5μg)的药敏片，37°C培养24小时后测量抑菌圈。

Antimicrobial activity

抗菌测试结果显示（图2a-c和表1），10 mM浓度下：3b抑菌圈(ZOI)为9.33±0.58 mm（弱活性）；3e为12.33±1.15 mm（中等活性）；1.0 mM时3e仍保持7.67±0.58 mm活性。值得注意的是，3f在所有测试浓度下均无抑菌活性。

Conclusion

本研究首次证实苯甲醇类似物3e能通过靶向sdrE蛋白干扰S. aureus的致病机制。3e与sdrE活性位点的稳定结合(-12 kcal/mol)使补体因子H(fH)的结合亲和力降低近6倍，这种"抢占式抑制"策略为开发抗S. aureus感染的新型抑制剂提供了创新思路。计算分析(PCA/FEL)显示3e- sdrE复合物具有最佳稳定性，DFT计算证实其反应活性与稳定性的完美平衡。