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基于改进图神经网络与变分自编码器的微生物-药物关联预测新方法GVNNVAE
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月10日 来源:Current Bioinformatics 2.9
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为解决微生物-药物关联预测难题,研究人员开发了GVNNVAE模型,整合改进图神经网络(GNN)与变分自编码器(VAE),通过构建异质网络提取拓扑与属性特征,最终实现0.9688的优异AUC值,为药物研发提供新工具。
微生物在人类健康与疾病中扮演关键角色。这项研究提出创新性预测模型GVNNVAE,巧妙融合改进版图神经网络(GNN)和变分自编码器(VAE)技术。研究团队首先构建了包含微生物、药物和疾病多重相似性特征的异质网络,随后通过改进GNN提取网络拓扑结构特征,同时利用VAE挖掘节点属性特征。最终整合原始属性与两类新特征,实现潜在微生物-药物关联的精准评分。实验数据显示,该模型AUC值高达0.9688,显著优于现有方法。典型案例验证进一步证实,GVNNVAE能有效预测未知微生物-药物相互作用,为临床治疗和药物重定位提供重要参考。
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