基于VEGFR2与c-MET免疫学特性的计算机模拟分析：乳腺癌mRNA疫苗设计的突破性探索

本研究通过免疫信息学方法，针对乳腺癌过表达的血管生成因子VEGFR-2和c-MET受体酪氨酸激酶(RTK)，创新性设计多表位mRNA疫苗。经分子对接(MHC)、动力学模拟及免疫反应验证，该疫苗能显著提升B细胞、细胞毒性T细胞(CTL)和辅助T细胞(HTL)活性，为克服传统疗法耐药性和高毒性提供新策略。

　　

亮点

研究流程

本研究通过十二步系统性流程实现：1）获取VEGFR-2和c-Met蛋白序列；2）预测评估细胞毒性T细胞(CTL)表位；3）筛选辅助T细胞(HTL)表位；4）T细胞表位与主要组织相容性复合体(MHC)分子对接；5）mRNA疫苗构建设计；6）疫苗理化性质预测；7）二级结构预测；8）蛋白质建模与3D结构优化；9）疫苗-受体分子对接；10）分子动力学模拟；11）免疫模拟；12）体外实验验证。

高抗原性蛋白筛选

从UniProt获取VEGFR-2(P35968)和c-MET(P08581)序列，其抗原性评分分别为0.5044(VaxiJen)/0.7782(ANTIGENpro)和0.4544(VaxiJen)/0.7366(ANTIGENpro)。VEGFR-2(1356aa)与c-MET(1390aa)的全长序列被用于后续研究。

CTL表位预测与评估

基于IEDB和NetMHCpan算法......

讨论

化疗等传统癌症疗法效果有限，而疫苗策略展现出革命性潜力。肿瘤疫苗开发涵盖全细胞、重组蛋白、DNA/mRNA疫苗等多种形式，其中mRNA疫苗凭借FDA成功案例成为焦点。本设计通过靶向VEGFR-2/c-MET双重通路，克服肿瘤血管逃逸机制，其诱导的强效抗体滴度和CTL/HTL应答为乳腺癌免疫治疗提供新范式。