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藜麦全基因组Aux/IAA基因家族鉴定及低温胁迫表达模式解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月11日 来源:Journal of Plant Growth Regulation 4.4
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为解决藜麦(Aux/IAA)生长激素基因家族功能未知的问题,研究人员通过生物信息学技术系统鉴定了39个CqIAA基因,发现其具有组织特异性表达模式,并揭示AUR62001002等基因在低温胁迫中的关键作用,为藜麦抗逆育种提供新靶点。
这项研究对藜麦中的植物生长激素基因家族(Aux/IAA)展开了系统性探索。通过全基因组扫描技术,科研团队成功鉴定出39个具有典型AUX/IAA结构域的CqIAA基因,这些基因被划分为2个主要类群和10个亚类。蛋白质特性分析显示,多数CqIAA编码酸性亲水蛋白,主要定位于细胞核,少数分布于叶绿体、线粒体等亚细胞结构中。
有趣的是,基因复制事件分析表明,串联复制可能导致部分CqIAA基因丢失。在启动子区域(2000 bp)中,研究者发现了丰富的光响应元件、植物激素响应元件以及逆境响应顺式作用元件。转录组数据揭示,某些CqIAA基因在根茎组织中呈现特异性表达模式,特别是AUR62001002、AUR62011942和AUR62011606等基因在低温胁迫条件下表现活跃,暗示这些基因可能构成藜麦应对寒冷环境的分子开关。
该研究不仅绘制了藜麦Aux/IAA基因家族的完整图谱,更为后续功能验证和作物抗逆改良奠定了重要理论基础。研究过程中采用的生物信息学策略,为其他非模式植物的基因家族研究提供了可借鉴的方法学框架。
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