全基因组关联分析揭示糯稻产量相关性状的遗传位点

为解决糯稻产量性状遗传基础不明的问题，研究人员对109份栽培糯稻材料进行两季田间试验，基于181万SNPs开展全基因组关联分析(GWAS)，鉴定出28个显著数量性状位点(QTLs)，其中11个为新发现位点，并锁定Os09g0375700等3个关键基因与千粒重和穗数显著相关。该研究为糯稻高产育种提供了精准分子靶点。

　　

提升产量潜力始终是育种家的核心目标，但糯稻(Oryza sativa var. glutinosa)产量相关位点的认知空白严重制约了高产品种的精准选育。这项研究通过对109份栽培糯稻种质资源开展两季田间表型分析，考察6个关键产量性状，并利用181万个单核苷酸多态性(SNP)标记进行全基因组关联分析(GWAS)，系统解析了谷物产量的遗传基础。

研究发现28个显著的数量性状位点(QTL)，可解释0.71-38.46%的表型变异。其中17个位点与既往报道重合或包含已知功能基因，而剩余11个位点可能携带新等位基因。在这些QTL区间内，研究者鉴定了379个候选基因，并对显著SNP邻近的候选基因进行单倍型分析。有趣的是，Os09g0375700、Os09g0396300和Os03g0609500三个基因的遗传变异与千粒重量或穗数变异呈现高度关联。

该研究不仅绘制了糯稻产量性状的遗传图谱，更鉴定出多个具有育种应用价值的分子靶标，为培育高产糯稻新品种提供了理论依据和技术支撑。特别值得注意的是，新发现的QTLs可能蕴含调控糯稻特有淀粉合成途径与产量形成协同进化的关键基因，这为后续功能研究指明了方向。