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T细胞相关诊断模型与PRF1介导的糖酵解在脓毒症中的作用机制:单细胞与转录组学证据及实验验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月12日 来源:European Journal of Medical Research 3.4
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本研究针对脓毒症早期诊断困难及免疫机制不清的临床难题,通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和转录组数据,构建了基于15个T细胞相关标志基因(如PRF1、LAG3等)的诊断模型(AUC 0.7-1.0),并首次揭示穿孔素(PRF1)通过调控糖酵解关键通路(G3P→3PD、PKM2等)驱动CD8+ T细胞免疫失衡的分子机制。实验验证显示PRF1敲除可显著降低炎症因子(TNF-α/IL-1β)和乳酸水平,为脓毒症提供了新的生物标志物和治疗靶点。
脓毒症是全球范围内导致死亡的主要危重症之一,每年造成超过1100万患者死亡。这种由感染引发的全身炎症反应综合征,早期症状隐匿且易与其他感染性疾病混淆,现有临床评分系统(如SOFA)难以精准识别个体差异。更棘手的是,脓毒症患者往往同时存在过度炎症和免疫抑制的双相障碍——初期"细胞因子风暴"导致器官损伤,后期则出现T细胞耗竭等免疫瘫痪现象。其中CD8+ T细胞比例异常已被证实与疾病严重程度密切相关,但具体调控机制仍是未解之谜。
针对这一临床痛点和科学问题,研究人员开展了一项多组学整合研究。通过分析29例脓毒症和36例对照的单细胞转录组数据,首次系统描绘了脓毒症免疫细胞图谱,发现T细胞(尤其是CD8+ T细胞)是疾病进展的核心调控者。差异基因富集分析显示,这些细胞显著激活了T细胞分化(P<0.05)和细胞毒性相关通路。基于此,团队利用LASSO算法从46个T细胞特征基因中筛选出15个关键标志物(含PRF1、LAG3等),构建的诊断模型在6个独立队列(n=396)中展现出稳定预测效能(AUC 0.88)。
代谢分析揭示PRF1与糖酵解通路(G3P→3PD等)呈强负相关。动物实验证实,CLP(盲肠结扎穿孔)模型小鼠的CD4+/CD8+ T细胞比值显著降低(P<0.01),同时PRF1表达和乳酸水平升高2.3倍。体外实验进一步表明,LPS诱导的巨噬细胞中PRF1 knockdown可使糖酵解标志物PFKFB3/PKM2下降40%,并通过Seahorse检测证实其调控ECAR(细胞外酸化率)和OCR(耗氧率)的能力。这些发现为理解脓毒症免疫代谢重编程提供了新视角。
关键技术方法包括:
整合29例脓毒症单细胞数据和6个GEO队列(n=396)的转录组分析
采用Seurat进行细胞聚类和CD8+ T细胞亚群鉴定
LASSO回归构建15基因诊断模型
scFEA(单细胞通量估算)分析代谢网络
CLP小鼠模型和LPS诱导的RAW264.7巨噬细胞模型验证
T cell serves as the important cell in sepsis
单细胞分析揭示脓毒症中T细胞(特别是CD8+亚群)比例异常,其46个差异基因主要富集于T细胞激活和NK细胞毒性通路(P<0.05)。
Different gene expression patterns between sepsis and health control
跨数据集分析鉴定出16个核心差异基因(如TLR5、HK3),在感染组中主要调控T细胞行为,在健康对照组中参与感染应答。
Diagnostic model for sepsis
基于UBE2C、PRF1等15个T细胞标志物构建的模型,在训练集(GSE134347)和验证集中AUC达0.7-1.0。
Metabolic alteration in sepsis
scFEA显示脓毒症T细胞的G3P→3PD等糖酵解通路活性显著增强(LogFC>0.2,P<0.001),与PRF1表达呈负相关。
PRF1 and glycolysis alteration in sepsis in vivo
CLP模型证实PRF1上调伴随CD4+/CD8+比值下降(P<0.01),糖酵解标志物PFKFB3/PKM2升高1.8倍。
PRF1 regulates glycolysis in sepsis
LPS实验中PRF1 knockdown使乳酸水平降低35%,并通过调控ECAR/OCR逆转糖酵解亢进(P<0.05)。
这项研究首次建立了T细胞相关的脓毒症诊断体系,并阐明PRF1通过"糖酵解-免疫失衡"轴调控疾病进展的新机制。临床转化方面,15基因模型为早期诊断提供了高特异性工具;基础研究层面,发现PRF1可同时作为预后标志物(ROC 0.88)和治疗靶点(敲除后炎症因子下降40%)。值得注意的是,该研究揭示了免疫代谢重编程在脓毒症双相障碍中的枢纽作用——糖酵解亢进既驱动初期炎症风暴,又导致后期T细胞耗竭,这一发现为开发靶向代谢的免疫调节疗法奠定了理论基础。
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