大肠杆菌ApaH双取向催化机制解析:Np4N去帽酶如何调控RNA寿命

【字体: 时间:2025年08月12日 来源:Nature Chemical Biology 13.7

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  来自国际团队的研究人员针对细菌中神秘的Np4N警报分子和Np4-capped RNA的降解难题,通过生物化学与结构生物学研究,揭示了大肠杆菌ApaH采用双结合取向的独特催化机制。该酶通过非特异性与半特异性结合的协同作用,高效水解多种Np4N并启动RNA的5'端依赖性降解,为RNA代谢调控及靶向药物设计提供了新视角。

  

最新研究揭开了大肠杆菌中神秘的双磷酸四核苷酸(Np4N)警报分子的代谢奥秘。这些被称为"细胞警报器"的小分子不仅能作为RNA的5'端特殊帽子(Np4 cap),还通过调控RNA稳定性参与细菌应激适应。研究团队聚焦于蛋白菌中关键的对称性水解酶ApaH,发现这个分子剪刀具备令人惊叹的灵活性——它能以两种不同方向抓住底物分子,具体取向取决于帽子结构和RNA首个核苷酸的特征。

通过高分辨率结构解析和生化实验,科学家们捕捉到ApaH与各种Np4N及带帽RNA的互动瞬间。虽然酶对底物取向存在轻微偏好,但其独特的"模糊识别"策略让它能高效处理多种分子变体。这种双取向结合机制不仅解释了ApaH广谱活性的结构基础,更为重要的是,它提示未来设计抑制剂时需考虑酶可能"耍花招"切换结合模式逃逸抑制。

研究证实,ApaH通过精准剪切Np4帽子触发RNA降解级联反应,直接影响信使RNA(mRNA)和小RNA(sRNA)的寿命。这些发现为理解细菌环境适应机制提供了新线索,也为开发针对RNA代谢通路的新型抗菌药物指明了方向——毕竟,要阻断这个灵活的分子剪刀,可能需要设计能同时阻断两种结合取向的"双保险"抑制剂。

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